104年度中央政府各主管機關函送財團法人預算案、營運及資金運用計畫至立法院者合計159家，以經濟部所轄39家財團法人為最多，農委會所轄30家財團法人次之；上開財團法人接受政府補助與委辦收入，103年度決算數為483.48億元、104年度預算數為456.80億元，其中以經濟部所轄財團法人金額為最高，103年度決算數299.45億元、104年度預算數275.71億元，其次為科技部所轄財團法人，103年度決算數74.11億元、104年度預算數77.14億元(詳附表2.1.1)。
而部分主管機關所轄財團法人由政府補助或委辦收入金額較小或為0者，係部分財團法人依法規命令設置，業務範圍以執行特定任務或公權力，以特別公課為收入來源，例如金管會所轄財團法人保險安定基金等5家；或部分財團法人由財產孳息收入作為營運經費來源而無需政府每年挹注經費，例如行政院(國防部)所轄國防工業發展基金會依設置條例成立時，政府捐助近47億餘元，每年度營運經費由財務收入支應，致仰賴政府挹注財源之程度較低。
附表2.1.1：中央政府各主管機關所轄財團法人一覽表
單位：家數；新臺幣億元
主管機關
所轄財團法人家數
政府補助與委辦收入
主管機關
所轄財團法人家數
政府補助與委辦收入
103年度
決算數
104年度
預算數
103年度
決算數
104年度
預算數
行政院(國防部)
1
0
0
經濟部
39
299.45
275.71
內政部
8
1.96
1.87
農委會
30
17.20
14.13
文化部
14
27.33
24.76
僑委會
2
0
0
外交部
3
11.44
12.44
衛福部
14
34.97
32.72
交通部
8
0.33
0.38
環保署
2
0.89
0.93
法務部
3
0.53
0.85
司法院
1
8.78
8.35
金管會
9
0.19
0.01
原民會
1
2.55
3.31
原能會
3
0.07
0
通傳會
1
0.32
0.79
科技部
3
74.11
77.14
蒙藏會
1
0.02
0.04
教育部
13
1.42
1.42
退輔會
1
0
0
陸委會
2
1.92
1.95
合計
159
483.48
456.80
※註：1.資料來源，各主管部會彙整之財團法人填報資料，本研究彙整。