(一)各機關委辦費應依主計總處所訂之用途別科目定義歸類，不得為規避統刪而以其他預算科目編列經費
為撙節各機關年度委辦經費支出，本院歷年審查中央政府總預算案時，均將委辦費列為統刪項目之一，99年度至104年度委辦費統刪比率多為10％（詳3-4-1）。而為避免各機關以其他預算科目編列委辦經費，藉以規避本院各年度委辦預算統刪決議，本院審查104年度中央政府總預算案時作成通案決議，各機關委辦費預算應確依主計總處所訂之用途別科目定義歸類，不得為規避統刪而以其他預算科目編列經費。
附表3-4-1：95-104年度立法院決議中央政府各機關委辦費之統刪比率 單位：％
年度
95
96
97
98
99
100
101
102
103
104
統刪
比率
10
18
12.5
5
10
10
10
10
10
10
※註：1.資料來源:各年度中央政府總預算案審查總報告。
2.102年度委託辦理統刪比率為10％，委託研究統刪比率為5％。
(二)本院雖每年度刪減各機關委辦費，然部分機關委辦費決算數卻年年超過預算數，與本院刪除是項費用意旨不符
1.預算法有關流用之規定：依預算法第62條規定：「總預算內各機關、各政事及計畫或業務科目間之經費，不得互相流用。」及102年12月修正公布之預算法第63條規定：「各機關之歲出分配預算，其計畫或業務科目之各用途別科目中有一科目之經費不足，而他科目有賸餘時，得辦理流用，流入數額不得超過原預算數額20％，流出數額不得超過原預算數額20%。但不得流用為用人經費，且經立法院審議刪除或刪減之預算項目不得流用。」
2. 103年度多達28個機關委辦費決算數超過法定預算數，部分機關流入數額甚至超過原預算數額20％，恐有違法之虞：依本院審議103年度中央政府總預算案時通案決議，各機關委辦費除部分機關或部分業務不刪，部分機關得改以其他項目刪減替代，科目自行調整外，其餘機關委辦費均統刪10％。查103年度各機關委辦費決算情形，計有國家安全會議等28個機關委辦費決算數超過法定預算數(詳附表3-4-2)；其中國史館、前行政院研究考核發展委員會、原住民族委員會、農糧署及所屬、疾病管制署、中央健康保險署、社會及家庭署、海岸巡防總局及所屬等8單位，均非前述委辦費不刪或得自行調整刪減科目之機關，其委辦費項目顯不具迫切性或必要性，然仍以流用方式致該年度委辦費決算數超過預算數，顯非允當。又國史館、前行政院研究考核發展委員會、警政署及所屬、中央健康保險署、國立傳統藝術中心、海岸巡防總局及所屬等機關，其流入數額均超過原預算數額之20％，恐有違反預算法第63條規定之虞，允應檢討改進。
附表3-4-2： 103年度委辦費決算數超出預算數之機關
單位：新台幣千元；％
機關名稱
103年度委辦費
預算數(1)
決算數(2)
增加數(3)=(2)-(1)
流用比率
(3)/(1)
國安會
0
182
182
-
國史館
540
692
152
28.15
臺灣文獻館
3,711
3,734
23
0.62
主計總處
1,490
1,744
254
17.05
研考會
22,743
35,660
12,917
56.80
原住民族委員會
201,864
214,588
12,724
6.30
退撫基金管委會
0
110
110
-
警政署及所屬
900
1,817
917
101.89
消防署及所屬
55,714
64,745
9,031
16.21
建築研究所
101,220
109,146
7,926
7.83
領事事務局
33,873
35,880
2,007
5.93
國防部所屬
30,510
30,985
475
1.56
財政部
11,850
11,965
115
0.97
賦稅署
7,799,474
7,811,35611,882
0.15
教育部
1,278,793
1,358,132
79,339
6.20
國民及學前教育署
1,276,512
1,418,335
141,823
11.11
台灣高等法院檢察署
0
535
535
-
智慧財產局
32,513
36,189
3,676
11.31
勞動部
200,786
201,780
994
0.50
農業試驗所
12,262
12,666
404
3.29
動植物防疫檢疫局及所屬
580,272
582,890
2,618
0.45
農糧署及所屬
69,808
76,515
6,707
9.61
疾病管制署
346,211
367,833
21,622
6.25
中央健康保險署
41,188
90,360
49,172
119.38
社會及家庭署
32,424
34,671
2,247
6.93
國立傳統藝術中心
14,658
22,918
8,260
56.35
海岸巡防總局及所屬
377
551
174
46.15
南部科學園區管理局及所屬
79,126
79,619
493
0.62
※註：1.資料來源:各機關提供，本研究彙整。
3.部分機關委辦費決算數連年超過預算數，預算執行控管顯不確實：按本院審查各年度中央政府總預算案時，統刪各機關委辦費之意旨，無非希各機關撙節委辦費支出，俾降低政府財政負擔。然查101年度至103年度各機關委辦費支用狀況，其中國家安全會議、國史館臺灣文獻館、公務人員退休撫卹基金管理委員會、前行政院研究考核發展委員會、原住民族委員會、警政署及所屬、建築研究所、國防部所屬、賦稅署、教育部、國民及學前教育署、台灣高等法院檢察署、農糧署及所屬、中央健康保險署、國立傳統藝術中心、海岸巡防總局及所屬等16機關單位(詳附表3-4-3)，其委辦費決算數連年超過法定預算數，預算執行控管顯不確實。又台灣高等法院檢察署、國家安全會議及公務人員退休撫卹基金管理委員會連年有委辦費需求，然各年度預算卻未編列，預算估列作業亦顯應檢討改進。
附表3-4-3：101年度至103年度委辦費決算數超出預算數之機關
單位：新台幣千元
機關
名稱
101年度
102年度
103年度
預算數(1)
決算數(2)
增減數(2)-(1)
預算數(1)
決算數(2)
增減數(2)-(1)
預算數(1)
決算數(2)
增減數(2)-(1)
國安會
0
0
0
0
2,291
2,291
0
182
182
臺灣文獻館
6,907
7,995
1,088
4,447
4,603
156
3,711
3,734
23
退撫基金管委會
2,500
2,211
(289)
0
110
110
0
110
110
研考會
32,180
43,433
11,253
24,532
32,899
8,367
22,743
35,660
12,917
原民會
196,398
196,127
(271)
155,331
161,520
6,189
201,864
214,588
12,724
警政署及所屬
1,330
1,757
427
764
1,965
1,201
900
1,817
917
建築研究所
108,590
123,771
15,181
100,706
112,612
11,906
101,220
109,146
7,926國防部所屬
15,491
33,515
18,024
19,748
28,456
8,708
30,510
30,985
475
賦稅署
7,816,086
7,832,168
16,082
8,171,996
8,190,520
18,524
7,799,474
7,811,356
11,882
教育部
2,026,796
2,254,386
227,590
1,035,011
1,251,336
216,325
1,278,793
1,358,132
79,339
國民及學前教育署
-
-
-
837,191
967,302
130,111
1,276,512
1,418,335
141,823
台灣高等法院檢察署
0
1,546
1,546
0
2,425
2,425
0
535
535
農糧署及所屬
182,596
184,131
1,535
57,243
68,549
11,306
69,808
76,515
6,707
中央健康保險署
54,126
94,440
40,314
55,459
90,787
35,328
41,188
90,360
49,172
國立傳統藝術中心
-
-
-
14,035
22,490
8,455
14,658
22,918
8,260
海岸巡防總局及所屬
466
526
60
419
526
107
377
551
174
※註：1.資料來源:各機關提供，本研究彙整。
(三)以委辦費辦理之研究案件數雖逐年遞減，然以補助費辦理之研究案卻倍增，似有藉此規避本院委辦費統刪決議之嫌
行政院所屬各機關研究發展實施要點第3點規定：「研究計畫之方式如下：1.本機關人員自行研究2.與有關機關人員共同研究3.與專家或學術機構合作研究。4.委託專家或學術機構專題研究。」經查各機關登錄政府研究資訊系統（以下簡稱GRB系統）之統計資料顯示，各機關97年度委外研究件數及經費為2,587件及160億元，103年度則減為1,197件及115億元(詳附表3-4-4及附表3-4-5)，其件數及經費支出雖逐年遞減，然補助研究案件數及經費卻逐年攀升。103年度各機關補助研究經費已達246億元，為97年度128.92億元之1.91倍，亦為103年度委外研究經費115.07億元之2.14倍；而該年度政府以各種方式辦理之研究計畫經費達441億元，較97年度之394億元，甚至增加約47億元。顯示在本院每年統刪各機關委辦費之際，部分機關研究案件有轉以補助費方式辦理之現象，其作為允非妥適。如經濟部及農委會委外研究經費雖逐年降低，然補助研究經費卻從101年度之154億餘元及1億餘元，增加至103年度之185億餘元及10億餘元；而教育部及科技部103年度委外研究經費雖不高，然補助研究經費卻高達16億餘元及20億餘元（如附表3-4-6）。
附表3-4-4：97年度-103年度政府研究計畫件數 單位：件
年度
自行研究(機關預算)
委託(研究/辦理)
合作/共同研究
補助(研究/辦理)
合計
97
2,090
2,587
133
543
5,353
98
2,265
2,455
104
867
5,691
99
2,494
2,399
147
731
5,771
100
2,477
2,193
137
649
5,456
101
2,283
2,190
123
621
5,217
102
2,307
1,418
175
1,321
5,221
103
2,116
1,197
145
892
4,350
※註：1.資料來源，97年度至101年度為GRB系統統計資料集，102年度及103年度為科技部提供資料。
2.本表不包括科技部學術補助之件數。
附表3-4-5：97-103年度政府研究計畫經費總額
單位：件; 新台幣百萬元
年度
自行研究(機關預算)
委託(研究/辦理)
合作/共同研究
補助(研究/辦理)
合計
97
10,057
16,003
421
12,892
39,373
98
8,783
14,942
162
16,332
40,219
99
8,722
12,890
341
18,278
40,231
100
8,071
13,408
242
18,221
39,942
101
8,123
21,744
182
16,977
47,026
102
8,014
12,228
255
20,502
40,999
103
7,660
11,507
315
24,600
44,082
※註：1.資料來源，97年度至101年度為GRB系統統計資料集，102年度及103年度為科技部提供資料。
2.本表不包括科技部學術補助之經費。
3.表列數據包含各地方政府研究經費，99年度至103年度各地方政府自行研究經費總計642萬7千元；委託研究經費總計7億1,880萬3千元；補助研究經費合計2,128萬6千元。
附表3-4-6：經濟部、農委會、教育部及科技部101年度至103年度委外研究及補助研究計畫經費 單位：新台幣千元
類別
委外研究經費
補助研究經費
年度
101
102
103
101
102
103
經濟部
18,856,986
10,262,721
9,658,354
15,404,554
16,578,408
18,583,247
農委會
1,022,719
361,315
372,319
141,640
721,002
1,067,672
教育部
9,254
55,147
54,384
555
1,304,086
1,670,886
科技部
12,400
22,566
0
0
165,129
2,085,461
※註：1.資料來源，101年度為GRB系統統計資料集，102年度及103年度為科技部提供資料。
2.本表不包括科技部學術補助經費。