衛生署針對中西醫雙修學程時間過短，恐影響行醫品質，且雙修之中醫生，往往都選擇西醫執業，也造成中醫人才流失，日前逕行宣布將修改醫事法，並建議教育部取消中西醫雙修學程。林鴻池委員對此，於立法院提出總質詢。

林委員表示，對於衛生署質疑中醫、西醫修業時間各七年，但若雙修，只需八年，專業部分令人質疑，恐影響行醫品質，各界也普遍認同，但若因此取消雙修學程，根本是倒因為果，本末倒置，尤其整合醫學是時勢所趨，中西雙修，截長補短。雙修的缺失，在於制度設計失當，可能導致雙修生學藝不精，該作的是重新檢討規定，例如將修業門檻提高、規定雙修生中醫執業滿幾年後，才能轉為西醫…等等。

衛生署楊志良署長認同林委員理念，並且表示，目前正與開設中醫科系之院校研議討論，尚無定案，也會保護學生權益，已循舊制入學者，根據法律信賴保護原則，將不受影響。未來對中西醫雙修的詳細規範，會廣納各界意見，與教育部會商討論後，再行公告。