因應貿易自由化，農業可能遭受的損害，政府編列了「農產受進口損害救助基金」，分年編列上千億元，農委會主委陳保基昨天在回答國民黨立委黃昭順質詢服貿協定中的弱勢是否可以使用「農產受進口損害救助基金」時，他語出驚人地表示，「可以」在他接任農委會主委前，上千億就已經被拿去做休耕地補貼，全部花光光，似是不當使用，日後的進口損害補助將使用公務預算編列。

在李登輝時代，政府為了加入ＷＴＯ開放農產品進口，前前後後和農民溝通了十多年，積極輔導農業轉型，還為此成立一千五百億元的「農業發展基金」、一千億元的「農產品受進口損害救助基金」。一方面厚植台灣農業實力，同時訂定配套補救措施，才敢逐步開放。

陳保基表示，「可以」補助服貿協定之下的進口損害，不過在他接任農委會主委前，政府依照計畫撥上千億元，就已經被拿去做休耕地補貼，全部花光光「一毛不剩」，他也坦承基金的使用比較寬鬆，似是不當使用，但是當時，每年因應ＷＴＯ要進口十四點四公噸的魚，影響了稻農的補助，所以才以這一筆類似預備金性質的基金，補助農民休耕。而日後的進口損害補助將使用公務預算編列。

此外自由經濟示範區特別條例可望年底前送立法院審議，陳保基指出，自由經濟示範區成立之後，禁止自中國大陸進口的八三零項農產品，可以進入自由經濟示範區加工，但是成品不能進入國內市場，必須全數外銷；如果自經區農產加工品要打上ＭＩＴ名號，就得符合ＭＩＴ產品規範，農委會將訂定查核方式。