幼托整合後，幼兒教育現場由2名幼教師變成1名幼教師1名教保員，雖然教保員與幼教師之職稱不同，但其工作性質雷同，而權益又與幼教師差異甚大，實務上產生諸如教保員與幼教師同工不同酬、難以落實勞動基準法規定與低薪困境等問題。其源頭在於現行制度下將教保員以勞動契約進用，其權益相關事項比照勞工，又無專業證照之情況下，其薪資待遇與社會聲望很難提高，有害於幼兒教保工作之進行。
為解決前揭問題，建議採分階段方式推動幼兒教育與保育系之整合，將幼教師與教保員合併為教保師，同時建立專業證照制度，並採取擴招公立幼兒園大班、提升幼兒園中班教保服務人員薪資等方法，逐步提高教保員薪資，解決同工不同酬問題，以改善整體之教保環境。