經濟部為有效提振經濟發展，改善投資環境，降低對國內失業率之衝擊，依據「工廠管理輔導法」第二十一條第五款規定，擬訂「未登記工廠第一期輔導處理方案」，將現行廠地坐落在一、都市計畫農業區、二、非都市土地特定農業區（辦竣農地重劃者除外）、一般農業區、鄉村區之農牧用地及夾雜其間之非丁種建築用地，而達「工廠管理輔導法」規定具公告工廠規模之工廠，經輔導土地變更符合土地分區使用管制規定，且作業屬低污染性，並經改善後可符合環保、建管、農業法令規定者，輔導其補辦工廠登記。因涉及都市計畫及非都市土地使用管制之體制、農地利用之良窳、環保及建管政策之落實等諸多因素，更衍生出政策之公平、合理及正義等問題，勢必對社會產生衝擊，故相關部會對此棘手案件相當審慎，希望衡量利弊得失後，找出最大公約數。

本文先敘述臺灣地區農地違章工廠之現況，及多年來存在之原因和對國內經濟之影響。因政策涉及經濟部、農委會、環保署及內政部之職權，各相關單位均審慎因應。本文以為違章工廠已存在多年，對我國經濟發展不無貢獻，取締既有其困難，且目前正逢國內經濟瓶頸，如能以符合公平、合理之方式輔導其合法化，對於個人、社會及國家，絕對有正面的幫助，最後建議數項原則，供決策單位參採，以解決此一「燙手山芋」。