台灣地區適合農作物生長，又奠基於日據時代至今的農業試驗改良體系及農學教育，擁有優秀的研發人員，並累積百年以上之研發經驗，加上農民多年之努力，使我國農業生產技術，具有一定之優勢，並且為世界主要農業技術輸出國。惟小農經營，生產成本偏高，再受到加入世界貿易組織之衝擊，面臨外來競爭與轉型之壓力。

為平衡北、中、南區域發展，促進農業高科技研發，加速形成農業科技產業群聚，厚植我國農業產業競爭力與經濟繁榮，及因應我國加入WTO之重大變革，體認以農業科技（包括生物科技）來改良農產品品種及提高農業生產力，是人類未來生存必然趨勢。我國經濟發展諮詢委員會決議及行政院「挑戰2008：國家發展重點計畫」，均要求加速規劃設置農業生物科技園區。行政院於92年間核定全國設置1處中央主導型（屏東）之「農業生物科技園區」）及4處地方主導型生物科技園區。本院於93年3月23日通過「農業科技園區設置管理條例」，規定主管機關應在園區內設置園區管理局，辦理各項管理工作，並提供各項服務。因此，行政院爰擬具「行政院農業委員會農業生物科技園區管理局組織法」草案，送本院審議。

草案經評估後，發現問題如下：一、管理局組織隸屬行政院農業委員會，該會組織條例未配合修正。二、管理局掌理事項應周延完整列明（草案第2條）。三、首長、副首長及主任秘書之職務列等之問題（草案第3條、第4條）。四、依中央行政機關組織基準法制定組織法，條文過於簡化，無法監督員額控管（草案第5條）。茲參據上述問題，研擬條文對照表，一併供委員審查時參考。