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背景說明
（一）新冠疫情快速蔓延期間，中央流行疫情指揮中心（以下簡稱疫情指揮中心）訂定「新冠疫苗接種計畫」，規定醫療院所施打疫苗，應以醫事人員、防疫人員極高風險接觸者為優先對象。有診所違反該計畫，將指揮中心配發之AZ疫苗，除施打在優先對象外，尚施打在744位未符優先施打對象資格者。《傳染病防治法》第29條第1項規定：「醫療機構應配合中央主管機關訂定之預防接種政策。」違反規定者，依同法第65條第3款規定，處新臺幣30萬元以上200萬元以下罰鍰。地方主管機關認為該診所違反「預防接種政策」，對診所開罰新臺幣200萬元。診所不服，提起行政訴訟。114年6月19日最高行政法院作出112年度上字第630號判決，撤銷新臺幣200萬元罰鍰處分該判決指出違反疫情指揮中心接種計畫或方案，不得逕依《傳染病防治法》第65條第3款規定予以處罰。
（二）另案A於110年8月22日自美國入境，經衛福部疾病管制署（以下簡稱疾管署）依《傳染病防治法》第58條第1項第4款 規定於同日對其開立「防範嚴重特殊傳染性肺炎入境健康聲明暨居家檢疫通知書」。令其自110年8月22日起入住防疫旅館進行居家檢疫以為隔離，直至同年9月5日24時為止，且9月5日解除隔離後，尚須返家進行7日自主健康管理。A不服原處分，乃於解除隔離及完成自主健康管理後，於同年9月30日以疾管署為被告機關，向管轄之臺北高等行政法院提起確認原處分違法之確認訴訟；高等行政法院作成110年度訴字第115號判決，確認原處分違法；疾管署不服該判決，再向最高行政法院提起上訴，最高行政法院作成112年度上字第81號判決，駁回該署之上訴。判決指出居家檢疫之方式，涉及人身自由受剝奪之程度，依《傳染病防治法》第59條第3項 規定，應由中央主管機關以法規命令規範，指揮中心以發布新聞稿方式，違反法律保留原則。
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