為促進國立大學校院財務之彈性運作，政府依國立大學校院校務基金設置條例規定設置校務基金，而教育部為發展高等教育及提升學校資源使用效率，107年度於「國立大學校院教學與研究輔助」及「國立大學校院校務及附設醫院基金」計畫分別編列預算數447億0,205萬5千元及38億7,763萬8千元(決算數相同)，以補助各校務基金教學、研究經費及資本支出經費。茲說明如下：
(一)107年度校務基金整體決算短絀雖較預算短絀及106年度決算短絀減少，惟六成以上校務基金仍為短絀，宜賡續檢討
1.國立大學校院校務基金設置條例第11條規定：「校務基金預算之編製，應以國立大學校院中長程發展計畫為基礎，審酌基金之財務及預估收支情形，在維持基金收支平衡或有賸餘之原則下，定明預估之教育績效目標，並納入年度財務規劃報告書，由國立大學校院公告之。」按國立大學校院由公務預算改制為校務基金，旨在賦予學校財務運用自主空間，鼓勵開源節流，提升運用績效；是以，校務基金之執行應以有賸餘或維持收支平衡為原則，各年度亦應以賸餘或改善短絀為目標。
2.107年度教育部於「國立大學校院教學與研究輔助」及「國立大學校院校務及附設醫院基金」計畫分別編列預算數447億0,205萬5千元及38億7,763萬8千元(決算數相同)，以補助各校務基金教學、研究經費及資本支出經費，而該年度計有50個校務基金，整體決算短絀23億6,003萬3千元，雖未達成收支平衡，惟較預算短絀60億6,576萬8千元，減少短絀37億餘元，亦較106年度整體決算短絀36億1,221萬6千元，減少短絀12.5億餘元，顯示107年度校務基金整體短絀情形漸趨改善中(詳附表1)。
3.107年度校務基金整體決算短絀雖較預算短絀及106年度決算短絀減少，惟台灣大學等31個校務基金決算仍為短絀，未能達成收支平衡或有賸餘之原則，且短絀學校比率超過六成；其中台灣海洋大學及台東專科學校之決算短絀較預算短絀及106年度決算短絀增加，另屏東大學決算短絀不僅較預算短絀增加，且由106年度賸餘轉為107年度短絀，允宜檢討短絀原因，俾予改進。
(二)部分學校實質賸餘減少，允宜賡續強化開源節流措施
1.為真實反映大學校務基金營運及財務運作績效，教育部訂有「不發生短絀方案」，該方案不計入餘絀計算項目，包括代管資產之折舊費用，政府補助款及民間捐贈指定用於資本支出所增置資產之折舊費用，與其他財源增置資產之折舊費用乘以最近5年國庫撥款增置之比率，另決算餘絀尚需減除該年度遞延收入轉列收入之數額。
2.據教育部提供校務基金實質賸餘情況，107年度校務基金整體實質賸餘61億餘元，較106年度增加14億餘元，惟台灣大學、台灣海洋大學、陽明大學、台北大學、屏東大學、彰化師範大學、台北教育大學、台灣科技大學等8個校務基金107年度實質賸餘較106年度減少，且據審計部107年度中央政府總決算審核報告指出，台灣大學、陽明大學、台灣海洋大學及台灣科技大學等4校實質賸餘連續2年減少，恐潛藏營運衰退或維持營運能力降低之疑慮或風險，允宜確實檢討實質賸餘減少原因。
3.國立大學校院校務基金管理及監督辦法第23條規定：「學校校務基金及各項自籌收入之執行，應以有賸餘或維持收支平衡為原則；如實際執行有短絀情形，學校應擬訂開源節流計畫，經管理委員會審議通過後執行。」107年校務基金整體決算短絀雖較106年度減少，惟逾六成學校仍短絀，8個學校實質賸餘減少，教育部允宜賡續督促各校妥擬開源節流措施，俾利確實改善以達收支平衡。
綜上，國立大學校院校務基金之營運，107年度整體決算短絀較預算短絀及106年度決算短絀減少，惟逾六成學校仍為短絀，且有8個學校實質賸餘減少，教育部允宜督促各校檢討營運短絀及實質賸餘減少原因，並落實辦理開源節流措施，俾利長期營運。
附表1：國立大學校院校務基金預、決算餘絀及實質餘絀情形
單位：新台幣千元
學校名稱
106年度
107年度
決算餘絀
實質餘絀
預算餘絀
決算餘絀
實質餘絀
台灣大學
-609,582
160,645
-676,568
-601,101
108,003
政治大學
15,810
218,633
-63,661
135,232
342,345
清華大學
-289,546
137,832
-450,189
-243,979
164,880
中興大學
-201,189
57,531
-250,376
-63,833
229,072
成功大學
-308,562141,459
-600,436
-158,443
235,493
交通大學
-397,208
10,768
-422,530
-325,718
49,171
中央大學
-156,910
68,837
-240,824
-136,874
81,477
中山大學
-77,596
120,737
-159,232
-57,577
136,326
中正大學
-195,350
42,158
-245,171
-186,372
57,108
台灣海洋大學
-101,534
68,297
-79,106
-113,620
58,656
陽明大學
-44,922
77,955
-96,063
-64,011
52,200
東華大學
-34,559
191,506
-164,892
19,596
232,084
暨南國際大學
-86,391
4,410
-103,431
-80,519
17,703
台北大學
3,548
129,822
-94,065
14,742
123,393
嘉義大學
-53,474
99,085
-82,557
6,335
157,572
高雄大學
-109,930
3,132
-109,532
-97,670
21,106
台東大學
-145,351
70,860
-204,738
-187,469
89,967
宜蘭大學
871
163,628
-70,344
-9,849
173,223
聯合大學
-14,374
94,379
-103,215
-6,140
132,732
台南大學
-54,582
9,934
-92,415
-44,881
20,927
金門大學
10,678
52,725
-9,793
50,007
81,166
屏東大學
13,552
158,083
-36,558
-52,914
131,414
台灣師範大學
-187,349
79,314
-172,339
-101,939
163,254
彰化師範大學
-90,455
33,025
-137,869
-98,301
29,840
高雄師範大學
-69,630
22,615
-103,828
-48,841
49,199
台北教育大學
54,239
84,624
2,856
19,530
59,575
台中教育大學
20,942
71,332
-2,525
42,993
92,120
台北藝術大學
-18,488
37,727
-37,367
29,625
83,607
台灣藝術大學
10,303
105,024
-50,829
51,648
149,983
台南藝術大學
-3,029
45,209
-26,078
-2,125
45,261
空中大學
28,526
41,185
-5,221
49,407
62,696
台灣科技大學
-6,933
181,230
-80,968
-9,585
177,882
台北科技大學
-51,893
275,558
-110,236
-13,715
322,354
雲林科技大學
-81,077
167,874
-129,431
-84,737
183,085
虎尾科技大學
-12,001
146,717
-68,435
35,308
204,412
高雄第一科技大學
-97,608
57,639
-98,136
-82,167
83,512
高雄應用科技大學
-71,096
212,969
-107,862
-70,559
247,352
高雄海洋科技大學
-63,435
47,069
-89,500
-57,283
63,093
屏東科技大學
-61,892
129,755
-117,872
-35,785
167,151
澎湖科技大學
-37,847
42,632
-78,430
-746
84,416
勤益科技大學
-70,365
83,571
-55,147
12,315
173,457
台北護理健康大學
8,507
73,272
-53,208
31,855
100,410
高雄餐旅大學
-30,974
74,701
-51,866
-20,973
89,118
台中科技大學
94,142
240,091
7,777
157,493
285,831
台北商業大學
6,855
97,740
500
9,647
118,795
體育大學
1,471
59,479
-27,142
62,634
156,457
台灣體育運動大學
46,555
96,579
-31,296
47,597
104,990
台灣戲曲學院
-2,440
55,741
-44,415
104
58,354
台南護理專科學校
-20,598
38,813
-26,657
4,101
63,202
台東專科學校
-70,037
22,391
-14,548
-82,472
33,971
合 計
-3,612,216
4,706,292
-6,065,768
-2,360,033
6,149,396
※註：1.資料來源，106年度及107年度審計部中央政府總決算審核報告-附冊附屬單位決算及綜計表非營業部分及教育部提供。
2.各校餘絀數與合計數之差異係進位尾差。
（分機：8655歐婉如）