工業局107年度歲入預算「其他收入」科目編列1億6,755萬1千元，決算數1億4,873萬1千元，其中雲林離島式基礎工業區(下稱雲林離島工業區)內廠商分攤工業用水設施成本列入「其他雜項收入」預算數1億4,279萬9千元，決算數1億3,374萬5千元。經查：
(一)相關雜項收入係用以收回雲林離島工業區工業用水專用設施工程經費
為供給雲林離島工業區所需工業用水，行政院於80年同意將該工業區用水納入集集共同引水計畫辦理供應，並由中央政府籌資興建完成集集共同引水計畫工業用水專用設施工程經費計59億3,982萬5千元(其中不含沉澱池之工業用水專用設施54億5,697萬7千元，沉澱池1期工程4億8,284萬8千元)。行政院87年1月13日台87經字第01724號函核示略以，雲林離島工業區工業用水專用設施工程所需經費，業已核定由用水事業單位負擔，該工程費係由中央先行籌款支應，將來該項費用及利息，仍應按計畫由中央從原水費用中收回；工業局遂將雲林離島工業區內廠商分攤工業用水設施成本納入歲入預算「其他雜項收入」以逐年收回上揭工程經費。
(二)雲林離島工業區區內廠商工業用水設施成本每年分攤金額低於工業局原設算年分攤數，工程經費回收年限將超逾40年
上揭工業用水專用設施工程建設成本59億3,982萬5千元，工業局以回收年限40年、年息3%計算每年應攤還金額計2億5,697萬1千元，經濟部於86年10月24日將上述攤還方案陳報行政院核備；惟工業局考量「集集共同引水計畫工業用水專用設施」用水目前尚未達到終期，且為減輕初期用水戶之負擔，分別以平均日用水量55.5萬噸(年用水量2億257萬5,000噸)及平均日用水量41.25萬噸(年用水量1億5,056萬2,500噸)，設算每噸工業用水須分攤工業用水專用設施(不含沉澱池)及沉澱池1期工程建造經費之費率計1.3041元(詳附表1)，並自99年1月1日起適用；另倘攤還金額於攤還年限內，仍未攤還完畢，則繼續攤還至攤還完畢為止。
據工業局資料，雲林離島工業區迄今僅麥寮區開發完成使用，區內廠商自99年度至107年度工業用水量共計9億1,831萬3,566噸，計收取工程經費攤還款11億9,615萬8千元(詳附表2)，僅占原設算年度攤還金額23億1,273萬9千元(2億5,697萬1千元*9)之51.72%；查自99年度至107年度間年度區內廠商工業用水量最高為99年度之1億879萬1,753噸低於計算沉澱池1期工程及其他工業用水專用設施每噸水應攤還金額之年用水量預估數，導致同期間工程經費攤還速率僅及原設算回收速率之5成左右。若該攤還速率未改變，則「集集共同引水計畫工業用水專用設施」工程經費之攤還期間恐超逾70年，高出行政院原核備40年之回收期限甚多；盱衡相關設施之耐用年限及重置成本，相關工程經費攤還之收回期間實不宜超逾40年過久。
附表1：雲林離島工業區每噸工業用水分擔專用設施建設成本表
單位：新台幣元；噸
項 目
年攤還金額
日用水量
年用水量
每噸用水分擔費用
集集共同引水計畫工業用水專用設施(不含沉澱池)
236,081,801
555,000
202,575,000
1.1654
集集共同引水後續計畫
沉澱池1期工程
20,889,162
412,500
150,562,500
0.1387
合 計
256,970,963
1.3041
※註：1.資料來源，工業局提供。
2.上表每噸用水分擔費用=年攤還金額/年用水量，該分攤費率自99年1月1日起適用。
附表2：近年度雲林離島工業區工業用水專用設施建設成本已攤還數一覽表 金額單位：噸；新台幣元
年度
用水量
分攤項目及金額(元)
合計
集集共同引水計畫
工業用水專用設施
(不含沉澱池)
集集共同引水
後續計畫
沉澱池1期工程
91
85,829,210
98,978,245
(尚未營運)
460,386,388
92
99,146,106
114,335,289
93
106,355,897
122,649,620
94
107,893,890
124,423,234
95
115,289,731
132,952,118
5,432,400
138,384,518
96
120,306,908
138,737,926
16,590,323
155,328,249
97
106,387,871
122,686,494
14,670,887
137,357,381
98
106,116,550
122,373,605
14,633,471
137,007,076
91年度至98年度小計
847,326,163
977,136,531
51,327,081
1,028,463,612
99
108,791,753
125,458,651
15,002,382
140,461,033
100
98,302,992
114,562,307
13,634,624
128,196,931
101
102,150,630
119,046,344
14,168,294
133,214,638
102
100,753,787
117,418,464
13,974,551
131,393,015
103
104,622,016
121,926,495
14,511,073
136,437,568
104
99,993,778
116,532,749
13,869,137
130,401,886
105
99,759,095
116,259,250
13,836,585
130,095,835
106
101,381,815
118,150,366
14,061,659
132,212,025
107
102,557,700
119,520,743
14,224,753
133,745,496
99年度至107年度小計
918,313,566
1,068,875,369
127,283,058
1,196,158,427
合 計
1,765,639,729
2,046,011,900
178,610,139
2,224,622,039
※註：1.資料來源，工業局提供。
綜上，集集共同引水計畫工業用水專用設施係專供雲林離島工業區工業用水之用，其由中央政府籌建，相關工程經費59億餘元後續再自工業原水用水戶之原水費用中逐年攤還；惟因該工業區現僅麥寮區開發完成並使用，且工業區內廠商用水量低於預估需求數，致該設施工程經費無法於40年內攤還，且恐超逾70年以上。考量設施使用年限及重置經費，工業局允宜預為籌謀因應，以期縮短工程經費回收年限。