教育部為改善高教M型化現象，107年度起實施高等教育深耕計畫(以下稱高教深耕計畫)，透過調整經費配置方式提供學生適足教育資源；該計畫期程自107年度至111年度，5年總經費836億元，108年度法定預算數166.81億元，審定決算數165.7億元。茲說明如下：
(一)高教深耕計畫之實施使資源過度集中少數學校情形逐漸調整，惟USR計畫執行欠佳，允宜賡續鼓勵大學提案，俾落實實踐國際連結與地方創生之社會責任
1.近10餘年來教育部為發展我國高等教育，陸續推動邁向頂尖大學計畫(以下稱邁頂計畫)、獎勵大學教學卓越計畫(以下稱教卓計畫)、推動典範科技大學計畫等多項競爭型計畫，雖對提升我國高等教育品質頗有助益，惟過於強調績效，導致資源過度集中少數學校及大學M型化發展之後遺症。
2.高教深耕計畫旨在提供學生適足教育資源，該計畫分為2大部分，第一部分內容包括主冊(學校整體發展)、附冊(促進大學社會責任實踐計畫(USR))及附錄(支持及協助學生發展)，第二部分內容主要係補助辦理國際競爭及研究中心計畫。由教育部提供經費分配情形觀察，其中頂尖大學部分，高教深耕計畫107年度及108年度所獲經費149.28億元，占2年度經費總額224.73億元之66.43%，而106年度頂尖大學於邁頂計畫所獲經費55億元，占該年度邁頂計畫及教卓計畫總額70.48億元之78.04%，顯示以往資源過度集中少數學校情形逐漸調整(詳表1)。
3.另高教深耕計畫第1部分之USR計畫，旨在鼓勵大專校院整合知識、技術及資源，從在地需求出發以善盡社會責任，預計總經費60億元；107年度及108年度USR計畫分別編列12億元及11億元，惟執行狀況欠佳，執行率僅51.56%及56.25%(詳表2)。據教育部109年4月送本院「促進大學社會責任實踐計畫(USR)與國際連結及配合地方創生作法施行情形」書面報告表示，109年度起調整計畫類型為大學特色類及新增國際連結類，除賡續強化在地連結外，亦鼓勵參與國際永續發展社群，將實踐成果接軌國際重要議題與場域，以提升學校國際影響力；鑒於USR計畫係大學師生整合知識、技術及強化在地實踐之優質場域，允宜賡續鼓勵大學提案，俾落實實踐國際連結與地方創生之社會責任。
表1 大學校院高教深耕計畫及邁頂計畫、教卓計畫經費分配概況比較表 單位：新臺幣億元
校別
高教深耕計畫107年度及108年度經費分配
邁頂計畫106年度經費分配
教卓計畫106年度經費分配
107年度
108年度
合計
政治大學
2.86
3.37
6.23
1.1
-
清華大學
10.00
11.50
21.50
7.6
-
臺灣大學
18.00
22.53
40.53
17.0
-
臺師大
2.07
2.28
4.35
1.3
-
成功大學
11.00
13.52
24.52
9.3
-
中興大學
3.52
4.03
7.55
1.8
-
交通大學
10.00
10.51
20.51
6.5
-
中央大學
4.15
4.19
8.34
3.9
-
中山大學
2.53
3.02
5.55
2.4
-
陽明大學
3.42
3.40
6.82
3.0
-
長庚大學
1.69
1.69
3.38
1.1
-
頂尖大學
小計
69.24
80.04
149.28
55.0
-
其餘大學
小計
37.66
37.79
75.45
-
15.48
合計
106.90
117.83
224.73
55.0
15.48
說 明：1.邁頂計畫106年度法定預算60億元，本表所列分配經費不含頂尖研究中心等分配數及台灣科技大學分配數1億元。
2.教卓計畫106年度法定預算22.7億元，本表所列分配經費不含促進教學資源整合項目等分配數。
資料來源：教育部提供。
表2 高教深耕計畫之USR計畫預、決算概況表 單位:新台幣千元；%
學校類別
107年度
108年度
大學校院
預算
600,000
500,000
決算
295,280
295,280
執行率
49.21
59.06
技專校院
預算
600,000
600,000
決算
323,493
323,493
執行率
53.92
53.92
大專校院
預算
1,200,000
1,100,000
決算
618,773
618,773
執行率
51.56
56.25
資料來源：教育部提供。
(二)部分大學排名有所提升，惟國際競爭益趨激烈，允宜督導各大學以前瞻及卓越視野賡續發展多元特色，俾留住人才
1.教育雖不應僅以排名衡量，惟大學排名乃多種面向總和之成績表現，係展現國際競爭力重要參考指標。茲以邁頂計畫補助之12所頂尖大學(詳表3之標註*學校)納入世界大學主要排名機構500名情形觀之，邁頂計畫第2期執行前之2010(-2011)年，THE(泰晤士高等教育)排名有4所、QS(英國高等教育評比機構)排名有9所、ARWU(上海交大)排名有7所；邁頂計畫銜接高教深耕計畫執行後，THE排名(2021)有3所、QS排名(2020)有10所、ARWU(2020)排名有4所，校數未有顯著增加。
2.復檢視臺灣大學、清華大學及交通大學3所大學執行邁頂計畫第2期及高教深耕計畫前後之排名，其中臺灣大學於最近一次世界大學排名，除ARWU排名稍降外，THE排名首次進入百大，QS排名亦係歷年最佳，整體排名狀況已有所提升；至其餘2校執行計畫後QS排名上升，惟THE排名均下降，清大由107名降至351-400名，交大則由181名降至未列入500名內，而ARWU排名清大及交大亦由314名及313名下降至401-500名。是以，邁頂計畫及高教深耕計畫之執行雖具成效，惟各國亦投入龐大經費提升高等教育品質，國際競爭益趨激烈。
3.有關我國大學在世界大學排名情形，據教育部109年5月送本院「高教深耕計畫深化高教人才培育」書面報告略謂，歐美系統排名較不利非英語系國家大學，主要係重要指標「論文引用率」相對不利非以英語為主要教學語言之大學，及逐漸受重視之「與國際學者共同發表論文」項目，亦與我國學術界多獨立完成研究或以中文進行共同發表之方式有所差異，致我國學校於國際化及被引用率等指標名次不高。高教深耕計畫重視均等發展，我國大學THE排名雖首次進入百大，然高教國際競爭益趨激烈，允宜督導各大學賡續以前瞻及卓越視野發展多元特色並與國際接軌，俾留住人才。
綜上，高教深耕計畫旨在提供學生適足教育資源，實施以來以往資源過度集中少數學校情形已逐漸調整，且我國大學THE排名亦首次進入百大，惟國際競爭益趨激烈，允宜督導各大學賡續以前瞻及卓越視野發展多元特色並與國際接軌，俾利培育及留住人才；另USR計畫執行狀況欠佳，允宜賡續鼓勵大學提案，俾落實實踐國際連結與地方創生之社會責任。
表3 我國大專校院世界大學排名表－排名500名內 單位:名次
校名
THE
QS
ARWU
2010
-2011
2021
2010
2021
2010
2020
*臺灣大學
115
97
94
66
127
201-300
*清華大學
107
351-400
196
168
314
401-500
*交通大學
181
-
327
240
313
401-500
*成功大學
-
-
283
234
256
301-400
*陽明大學
-
401-500
290
298
447
-
*臺灣科技大學
-
-
370
267
-
-
臺北醫學大學
-
301-350
-
387
-
-
*中央大學
-
-
398
465
443
-
*臺灣師範大學
-
-
451-500
331
-
-
*中山大學
163
-
401-450
416
-
-
*長庚大學
-
-
-
493
406
-
*中興大學
-
-
-
-
-
-
*政治大學
-
-
-
-
-
-
中國醫藥大學
-
401-500
-
-
-
201-300
高雄醫學大學
-
-
-
-
-
-
台北科技大學
-
-
-
488
說 明：1.本表校名列示獲邁頂計畫補助之頂尖大學(以*標於校名前，惟不另包括獲邁頂計畫補助研究中心之大學)及排名500名以內之大學；校名原則依「教育統計指標之國際比較2016」之順序列示。
2.本表年度原則以世界大學排名機構官網所列年度列示；而排名僅列各機構500名以內排名，THE官網2010-2011年排名僅列至200名。
資料來源：2010(-2011)年數據引用「教育統計指標之國際比較2016」之2010(-2011)年資料，其餘年度數據引用THE(泰晤士高等教育)、QS(英國高等教育評比機構)、ARWU(上海交大)世界大學排名機構官網資料(查詢日：109年9月13日)。