行政院主計總處(下稱主計總處)112年度於「中央總預算核編及執行」計畫編列預算數448萬4千元，決算數444萬6千元；「特種基金預算核編及執行」計畫編列預算數266萬1千元，決算數263萬3千元，執行率99.15%及98.95%，預期成果包括：促使各機關加強特種基金預算管理，提升特種基金營運效能等。截至112年度中央政府特別收入基金計有27個附屬單位(含29個分預算），近年部分該類基金核有高度仰賴國庫撥補、年度收支由餘轉絀或連年短絀之情形，謹敘明如次：
(一)特別收入基金依預算法等相關規定，基金來源應有國庫撥補以外之適足財源，且在法定財源範圍內，本於量出為入原則，依設立目的妥善資源運用
特別收入基金依預算法第4條第1項第2款第5目規定，係屬具備特定收入來源而供特殊用途之特種基金，又依中央政府特種基金管理準則第4條第3項規定，特別收入基金「應在法律或政府指定之財源範圍內，提升資源使用效率，以達成基金設立目的。」亦即以專款專用方式，就法定財源挹注於符合基金設立目的政務之經費所需，其財務規劃運用亦適用量出為入原則；在特別收入基金之財源籌措方面，參照財政紀律法第8條第1、2項規定：「中央政府非營業特種基金須依法律或配合重要施政需要，按預算法第4條規定，並應具備特(指)定資金來源，始得設立。」、「前項基金屬新設者，其特(指)定資金來源應具備政府既有收入或國庫撥補以外新增適足之財源，且所辦業務未能納入現有基金辦理。」亦即特別收入基金係屬收支獨立個體，為避免增加國庫負擔，應具備國庫撥補以外之適足收入來源支應法定用途，以確保基金之穩健運作。
(二)110至112年度計有8個特別收入(分)基金之收入連續2年以上逾9成源自國庫撥補
依中央政府各特別收入基金歷年決算資料，110至112年度計有農業天然災害救助(分)基金等8個特別收入基金，連續2年(含)以上其收入逾9成源自國庫撥款(詳表1)，其中除農業天然災害救助(分)基金、新住民發展基金與家庭暴力及性侵害防治(分)基金外，其餘5個特別收入基金源自國庫撥款之占比多呈逐年增加趨勢；至於同期間該等基金之國庫撥款收入規模變動情形，除新住民發展基金外，其餘7個特別收入基金源自國庫撥款收入之金額均呈增加趨勢，對國庫構成一定程度之負擔，其財務自主性容有提升空間。
表1 特別收入(分)基金110至112年度連續2年(含)以上接受國庫撥款收入占比均逾9成者之明細表 單位：新臺幣億元；%
年度別
基金別
110
111
112
國庫撥款收入金額(A)
(A)占基金來源比率
國庫撥款收入金額(A)
(A)占基金來源比率
國庫撥款收入金額(A)
(A)占基金來源比率
農業天然災害救助(分)
23.12
99.91
32.14
99.84
51.81
99.81
國土永續發展
0.92
98.92
91.64
99.31
100.00
99.50
毒品防制
4.25
97.48
4.25
99.77
5.67
98.61
行政院公營事業民營化
88.00
89.17
88.00
93.72
88.85
98.37
新住民發展
5.00
98.23
5.00
99.21
4.00
98.04
家庭暴力及性侵害防治(分)
2.35
97.51
3.60
98.09
4.47
96.34
行政院國家科學技術發展
350.40
95.71
403.21
96.26
388.79
96.23
農產品受進口損害救助(分)
118.53
91.32
136.05
92.16
159.94
93.61
資料來源：各特別收入基金歷年決算書。
(三)110至112年度整體特別收入基金年度收支均有賸餘，惟部分特別收入(分)基金由餘轉絀或有連年收支短絀之情形
依110至112年度中央政府總決算附屬單位決算及綜計表審核報告(非營業部分)，計有27個特別收入基金且整體年度收支均有賸餘，規模介於507億餘元與697億餘元間，惟花東地區永續發展基金與毒品防制基金110年度雖有賸餘，111年度起則由餘轉絀；私立高級中等以上學校退場基金、農業特別收入基金、就業安定基金、通訊傳播監督管理基金及反托拉斯基金則呈連年短絀(詳表2)，該等基金之財務管控措施容待強化。
表2 特別收入(分)基金110至112年度收支餘絀概況表
單位：新臺幣千元
年度別
基金別
110
111
112
中央研究院科學研究
133,505
448,929
533,297
行政院國家科學技術發展
1,224,532
2,931,288
2,786,626
離島建設
(1,005,120)
(1,239,606)
23,093
行政院公營事業民營化
1,463,170
622,599
114,811
花東地區永續發展
22,952,723
(2,390,785)
(2,822,822)
促進轉型正義
-
948,726
541,693
新住民發展
162,693
132,484
67,603
研發及產業訓儲替代役
(27,032)
1,539
(8,984)
警察消防海巡移民空勤人員及協勤民力安全
(4,588)
(7,704)
1,612
國土永續發展
(127,579)
8,929,237
9,648,351
學產
99,902
631,914
106,416
運動發展
(318,538)
289,931
741,848
私立高級中等以上學校退場
(20,579)
(9,493)
(23,751)
毒品防制
4,256
(157,967)
(98,783)
經濟特別收入
1,888,794
2,937,923
461,466
核能發電後端營運
20,907,266
23,331,299
22,501,728
航港建設
1,945,993
2,801,866
43,337
核子事故緊急應變
19,755
18,179
28,427
農業特別收入
(10,769,409)
(2,920,949)
(9,249,700)
就業安定
(11,719,005)
(7,647,633)
(1,127,308)
衛生福利特別收入
26,569,028
39,816,998
33,225,683
環境保護
(3,547,327)
(666,392)
628,461
文化發展
-
-
108,926
金融監督管理
1,187,376
1,243,684
1,051,397
通訊傳播監督管理
(290,277)
(264,948)
(8,290)
有線廣播電視事業發展
13,760
12,263
15,533
反托拉斯
(28,092)
(27,907)
(55,969)
合計
50,715,207
69,765,475
59,234,701
說 明：1.原大專校院轉型及退場基金自112年起更名為私立高級中等以上學校退場基金；促進轉型正義基金自111年度始設立；文化發展基金自112年度始設立。
2.基金年度收支有短絀者以括弧標示。
資料來源：審計部歷年「中央政府總決算附屬單位決算及綜計表審核報告-非營業部分」，本中心彙整。
綜上，110至112年度中央政府部分特別收入基金有高度仰賴國庫撥補、年度收支由餘轉絀或連年短絀之情形，主計總處允宜督促該等基金強化財務管理作為，俾減輕國庫負擔及符合基金設置之本旨。