國家中醫研究院設置條例於115年8月25日經立法院第11屆第5會期第23次會議三讀通過。
本次設置國家中醫研究院之行政法人組織，其監督機關為衛生福利部，設有董事會置董事11人至15人（其中一人為董事長）與監事3人，分別負責重大政策審議與財務監督；另置院長1人，負責該院營運與管理業務之執行及督導中醫研究教學附設醫療機構；附設之醫療機構置負責人1人，負責醫療機構之管理。該中心經費來源為政府預算之核撥及捐（補）助及其他收入；為保留組織彈性，得自訂人事管理、會計制度及內控稽核等規章，依章進用人員不具公務人員身分；並由監督機關辦理該院績效評鑑。
本條例制定施行後，將以公法性質之行政法人組織，加速推動國家中醫發展，促進中醫臨床精準治療研究，提升中醫藥產業競爭力。
