中央行政機關組織基準法在民國93年6月11日經本院三讀通過，旋奉總統於同年月23日公布施行。該法係中央政府機關組識設立之原則、規模與程序之基準大法，原為政府組織改造工程之重要法案，但配套之行政院組織法修正草案、中央政府機關總員額法草案未能完成立法，使其組織再造工程部分先執行。該法實施成效仍難顯現，惟當初所憂心之缺失已逐漸顯現，送至本院審議之組織法律案缺乏實體內容，造成立法權遭到實質漠視。
中央行政機關組織基準法實施3年來，所送至本院審議之組織法案體例新舊雜陳。組織法律內容在缺之配套法案下顯得空洞，欠缺明確性及可預見性，就行政組織之法律保留原則，尚須檢討再做適度之限制。且甚至發生扭曲該法立法意旨，認為組織可跳空設置，而自行以行政命令決定機關層級及任意更改組織名稱等事件，引發爭論。為應當前爭議問題獲得改善，使立法權與行政組織鬆綁取得良性衡平，本文就法律保留原則觀點，針對組織立法權，探討民主與效率之爭議、組織法律修正體例不一 、組織層級定位不清 及組織法律內容空洞 等問題，本報告經研析後提供建議及修正條文對照表，供委員審議該法案之參考。
