金融機構合併法第19條規定「金融機構依本法合併、改組或轉讓時，其員工得享有之權益，依勞動基準法之規定辦理。」惟勞動基準法對事業單位改組或轉讓之勞工權益，僅在該法第20條作出極為簡略之規範，實無法給予整併下之員工以周全之保障。而企業併購法第15條至第17條，對於公司整併其員工權益之維護，卻有相當縝密且完善之規定，足為金融機構合併法第19條修正之參考。另金融機構合併法第16條雖已明定在申請合併案附具之「合併契約書」中，應包含對受僱人權益處理等重要事項，惟因相關規定過於含糊，以致公司宣佈合併後，員工往往因不滿公司之處理方式而發生抗爭情事，為維護受僱人權益，亦有必要修正相關規定。至於被借鏡之企業併購法第16條，亦有值得檢討改進之處。
本專題研究報告，首先，概要敘述國內金融機構擴張與整併之來龍去脈。其次，扼要說明金融機構合併法涉及員工權益之相關規定，以及因衍伸而適用之勞動基準法相關條文。接著，介紹企業併購法有關公司整併對員工權益之保障規定，並就其與勞動基準法作一相互比較。之後，就金融機構合併法中涉及員工權益之條文進行檢討，並提出（一）申請合併之契約書，要求記載內容過於含糊籠統，未充分揭露相關資訊，不符法律明確性原則；（二）金融機構整併其員工應享之權益，所適用之勞動基準法規定，不及企業併購法對員工權益之保障；（三）企業整併時同意留用之員工，嗣因個人因素不願再留任，於一定期限內，應有向新雇主請求發給資遣費之權利等意見。最後，根據檢討意見，就金融機構合併法第16條、第19條及企業併購法第16條提出修法建議，並列出兩張建議修正條文對照表，供委員修法參考。
