依WTO烏拉圭回合農業協定將農業補貼分為琥珀色措施、藍色措施及綠色措施，其中琥珀色措施恐造成貿易扭曲效果而不被允許，故，我國為因應加入WTO，有關屬於琥珀措施之保價收購，必須逐年削減，因而改以休耕補貼政策。然而休耕政策原本用意係為恢復農地地力而採行之政策，但依我國歷年之休耕面積及每年高達百億元之休耕補貼經費觀之，似不見休耕農地復耕之跡象，反而逐年增加，造成農地荒廢及病蟲茲生，不利於我國糧食自給率的提升與永續農業經營。
近年來環境破壞造成氣候異常的現象，致使國際間開始提倡顛覆傳統以高投入、高產出並藉由化學原料刺激生產所引發生態嚴重污染的農作方式，改以減少外來物質投入、並以有機生產。然而，慣行農法轉型為有機耕作之轉型期以及取得有機驗證初期，有機農產品栽培不易，且因我國耕作面積及產銷不具經濟規模，又必須面對與進口有機農產品競爭，造成國內有利農業永續經營之有機農業耕作面積僅占農地總面積0.55％，確有必要針對我國有機農業進行擴大生產及經營規模、協助農民技術等輔導工作，以加速我國有機農業蓬勃發展，爰參酌歐盟、美國等國家提升有機農業耕作面積之獎勵措施，進而檢視現行法令政策及執行現況，提出以下建議：
一、明定有機農產品及農產加工品於轉型期間之補貼機制，以符合WTO綠色補貼規範。
二、為維持環境保育及農業永續經營，建立轉型期後持續補貼機制。
三、參酌美國驗證費用分攤政策，明定有機驗證相關費用之補貼規定，以降低有機農民生產成本。
四、集團驗證與個別驗證等相關定義未明，恐造成疑義，為杜爭議，爰將產銷履歷農產品驗證管理辦法相關定義提升至本法，以資明確。
