中研院於本（100）年5月提出「研教與公務分軌體制改革建議書」（以下簡稱「中研院改革建議書」），以其身為全國最高學術研究機構，對於公務體制造成研教機構之束縛與限制感受甚深，故呼籲政府落實「公教分離」政策，其改革建言則建議以修正科學技術基本法第5條、第6條、第13條、第14條及第17條等部分條文為解決方案，而一舉解決研教機構所面臨之採購、兼職、合聘、人員培養等問題。嗣經行政院研議，該院於本（100）年8月31日以院臺科字第1000102563號函送「科學技術基本法第6條及第17條條文修正草案」請本院審議，案經提交本院第7屆第8會期第1次會議報告後決定，交教育及文化委員會審查。
本報告爰針對「中研院改革建議書」並對應行政院版「科學技術基本法第6條及第17條條文修正草案」逐一評估，提出以下建議：（一）我國現行已有彈性薪資方式可供延攬人才，惟「教師待遇條例」草案應儘速完成立法，並應落實教師評鑑制度，大學應積極增加自籌經費，另可考慮進行法人化而自訂其研教人員之薪資制度；（二）何者屬績優研教機構難以認定，以空白授權之行政命令排除採購、預算及審計相關法律之適用，有違依法行政原則；（三）研教機構運用委託款辦理之科研項目採購，應可比照運用補助款者，排除政府採購法之適用；（四）研教機構以受贈現金辦理之採購，可參照大學校務基金就收支管理排除法令限制之精神，不適用政府採購法；（五）為避免智慧財產權及成果之處分，因執行研發單位之性質而有所差異，雖可明定公立執行研發單位之處分不受國有財產法限制，惟政府介入權之要件與法律效果應於法律內明定，並應刪除收歸國有之態樣；（六）公立研教機構科研人員兼職之限制雖可放寬，但技術作價投資仍應受公務員服務法所定投資之限制，以避免影響本職；（七）研究機構若欲設置科學研究基金，應先釐清其設立目的、基金來源及運用範圍後始得為之；（八）合聘與博士後研究人員之制度並非科技研發人員所獨有，應配套修正其他人事法律等，以供本院委員參考。
