歷史上曾經發生過許多重大的傳染性疾病，奪走了數以百萬或千萬計的人類性命，傳染病對於人類的健康與生命所構成的威脅，一直是個極為重要的問題。國際間人口的頻繁移動，農漁牧產品的開放進口，皆有可能將傳染病帶入國內而造成大流行，除威脅國人健康外，增加醫療費用支出，波及經濟成長，其影響層面甚廣。為防止傳染的大流行，對傳染病防治的落實，不容掉以輕心。傳染病防治工作是國家衛生政策相當重要的一環。
現行傳染病防治法第3章專章規定傳染病預防，行政院鑑於國內預防接種政策的推動上遭遇許多困難，包括新疫苗因為缺乏財源而遲遲無法引進國家接種計畫、國際疫苗供需失衡等問題，故常規實施之各項預防接種經費囿於政府財源及年度預算之限制，對於新增預防接種項目，無法推動，因而無法因應防疫及民眾的需求。
是以，行政院基於防治傳染病之急切需求，同時考量經費來源及國際趨勢等因素，爰提出「傳染病防治法第27條條文修正草案」增訂設置基金，將新疫苗導入常規接種，以確保疫苗之財源，業經97年6月16日院臺衛字第0970086806號函送本院審議，經提本院第7屆第1會期第7次會議報告後決定：「交衛生環境及勞工委員會審查」。
本報告針對行政院所送草案內容經研析後，除建議草案第27條將基金名稱與目的明定外，並建議修正中央主管機關之職權，增修第5條第1項第1款第3目為設立全國疫苗基金等有關事項；增訂第27條之1規定，將基金來源及用途明定之，俾利基金之運作；增訂第27條之2規定，行政院衛生署為採購疫苗及推動預防接種政策，得組成傳染病防治諮詢小組。
