(一)現行法律規定

1.《納稅者權利保護法》第11條規定，稅捐稽徵機關或財政部賦稅署指定之人員應依職權調查證據，對當事人有利及不利事項一律注意，其調查方法須合法、必要並以對納稅者基本權利侵害最小之方法為之。稅捐稽徵機關就課稅或處罰之要件事實，除法律別有明文規定者外，負證明責任。

2.《納稅者權利保護法》第14條規定，稅捐稽徵機關對於課稅基礎，經調查仍不能確定或調查費用過鉅時，為維護課稅公平原則，得推計課稅，並應以書面敘明推計依據及計算資料。稅捐稽徵機關推計課稅，應斟酌與推計具有關聯性之一切重要事項，依合理客觀之程序及適切之方法為之。

3.《納稅者權利保護法》第18條規定，最高行政法院及高等行政法院應設稅務專業法庭，審理納稅者因稅務案件提起之行政訴訟。稅務專業法庭，應由取得司法院核發之稅務案件專業法官證明書之法官組成之。辦理稅務案件之法官，每年應接受一定時數之稅務專業訓練或在職研習。稅務專業法庭之組成、稅務案件專業法官證明書之核發標準、辦理稅務案件法官每年所應受之訓練及相關辦法，由司法院定之。

(二)納稅者權利保護法實施前後之稅捐案件行政救濟情形

1.復查及訴願情形

(1)復查件數104年為9,513件，109年為3,196件，逐年下降(詳表24)。

(2)復查「撤銷」件數為92件至375件，占比介於3.98~5.57%，概呈逐年下降。

(3)復查「部分撤銷、部分駁回」件數為425件至1,164件，占比介於17.11%~20.99%。

(4)復查「移轉更正」件數為360件至817件，占比介於12.04%~18.25%。

(5)復查「駁回」件數為700件至3,420件，占比介於30.26%~50.38%，逐年下降。

(6)復查「撤回」件數為736件至1,012件，占比介於14.91%~31.82%，逐年提升。

(7)訴願決定案件，「撤銷」件數占比僅7.05%~16.32%，「駁回」高達83.68%~92.95%。

2.行政訴訟情形

(1)彙整財政部訴願決定經行政法院裁判結果及撤銷理由分析統計表(詳表25)，104至108年裁判件數分別為864、872、705、586、489件，同期間撤銷件數分別為88、69、65、55、41件，撤銷比率分別為10.19%、7.91%、9.22%、9.39%、8.38%。

(2)撤銷理由主要為行政法院法令見解事實認定與行政機關不一致，約占8成，其他撤銷理由包括行政訴訟時提出新證據請重新調查、行政訴訟時法令變更請重新調查、行政訴訟時事實變更請重新調查、認定事實未臻明確、原處分或原決定不當、行政法院見解前後不一致等約占2成。