高教深耕計畫第2期第2部分主軸係協助大學追求國際一流地位及發展研究中心，分為「全校型計畫」及「特色領域研究中心」2計畫，112年度決算實現數65.34億元占預算數66.89億元之97.68%，113年度預算續編列67.48億元，惟：
(一)全校型計畫僅國立一般大學4校，允宜適度揭露審核評選機制及選定理由
1.全校型計畫第1期執行成果亮點：全校型計畫係協助具多面向國際競爭力之綜合性大學，在優勢領域建立卓越特色與全球領先地位，使學術研究發展接軌國際並提升整體國際競爭力，高教深耕計畫核定補助學校為國立臺灣大學、國立成功大學、國立清華大學及國立陽明交通大學4校，執行成果亮點之量化成果如表3-2-1。
表3-2-1 高教深耕計畫第1期「全校型計畫」執行成果亮點(量化成果)
量化成果
單位
107年
108年
109年
110年
111年
碩博士學位國際學生人數
人數
2,113
3,890
4,409
4,671
4,679
學校補助專任教師研究人數
人數
1,306
1,116
2,375
2,249
5,566
與國外學者共同開授課程數
課程數
293
318
158
254
237
畢業生赴國外一流大學就學人數
人數
454
696
907
563
700
國際合作研究計畫件數
件數
382
399
371
284
354
高引用率(HiCi)論文數
篇數
1,353
1,466
1,506
1,673
1,833
資料來源：教育部(113年5月6日)提供。
2.主要世界大學排名，我國入榜大學除國立大學，尚有技專校院及私立大學：各種世界大學排名調查之指標類型、計算方式及評估重點各異，而不同類型大學在研究、教學或實務各有所長，據泰晤士高等教育(THE，Times Higher Education)公布113年世界大學排名(World University Rankings 2024)，臺灣共45所大學入榜，進入全球500名內共有7所，入榜大學數量較去年多，且多數學校名次呈現上升現象(詳表3-2-2)。另英國高等教育調查中心（QS，Quacquarelli Symonds）113年6月公布「2025世界大學排名(QS World University Rankings 2025)」，臺灣有27校進入排行榜，其中8所大學在500名內(詳表3-2-3)，近年主要世界大學排名，我國入榜或排名進步之學校，亦不乏私立一般大學及國立技專校院。
表3-2-2 THE 113年世界大學排名我國大學入榜45所之前20排名概況表
序號
大學名稱
113年
名次
112年
名次
序號
大學名稱
113年名次
112年名次
1
國立臺灣大學
152
187
11
長庚大學
501-
600
1001-
1200
2
中國醫藥大學
301-350
251-300
12
國立中山大學
501-
600
801-
1000
3
亞洲大學
401-500
351-400
13
高雄醫學大學
801-
1000
1001-
1200
4
國立臺灣科技大學
401-500
601-800
14
國立臺北科技大學
801-
1000
1001-
1200
5
國立清華大學
401-500
501-600
15
中原大學
1001-
1200
1201-
1500
6
國立陽明交通大學
401-500
501-600
16
輔仁大學
1001-
1200
1001-
1200
7
臺北醫學大學
401-500
301-350
17
明志科技大學
1001-
1200
1201-
1500
8
國立成功大學
501-600
601-800
18
國立中央大學
1001-
1200
1001-
1200
9
國立臺灣師範大學
501-600
801-
1000
19
國立政治大學
1001-
1200
1201-
1500
10
國立雲林科技大學
501-600
601-800
20
國立中興大學
1001-
1200
1201-
1500
說 明：臺灣入榜大學第21所係名次區間1201以後，囿於版面故未列示。
資料來源：112年10月20日，「[THE泰晤士]2024世界大學排行，臺灣45校入榜」，「大學問」網站(113年5月10日檢索)，本報告彙整。
表3-2-3 「2025世界大學排名(QS World University Rankings 2025)」我國大學入榜27所排名概況表
序號
大學名稱
113年
排名
112年
排名
序號
大學名稱
113年排名
112年排名
1
國立臺灣大學
68
69
15
長榮大學
1001-
1200
1001-
1200
2
國立清華大學
210
233
16
中原大學
1001-
1200
1001-
1200
3
國立成功大學
215
228
17
國立中正大學
1001-
1200
901-950
4
國立陽明交通大學
219
217
18
朝陽科技大學
1201-
1400
1201-
1400
5
國立臺灣科技大學
392
387
19
逢甲大學
1201-
1400
1201-
1400
6
國立臺北科技大學
425
431
20
輔仁大學
1201-
1400
1201-
1400
7
國立臺灣師範大學
452
431
21
國立東華大學
1201-
1400
1201-
1400
8
國立中山大學
485
505
22
國立臺北大學
1201-
1400
1201-
1400
9
國立政治大學
601-610
567
23
國立臺灣海洋大學
1201-
1400
1201-
1400
10
臺北醫學大學
611-620
577
24
淡江大學
1201-
1400
1201-
1400
11
長庚大學
631-640
621-630
25
東海大學
1201-
1400
1201-
1400
12
國立中央大學
641-650
611-620
26
元智大學
1201-
1400
1201-
1400
13
國立中興大學
661-670
661-670
27
東吳大學
1401+
1400+
14
亞洲大學
801-850
901-950
-
資料來源：113年 6月7日「[2025 QS]臺灣27校進世界大學排行 臺大68名」，「大學問」網站(113年6月12日檢索)，本報告彙整。
3.允宜適度揭露全校型計畫之評比機制及選定理由，並滾動檢討辦理成效，俾協助建立國際領先優勢：「全校型計畫」補助學校為國立臺灣大學等4校，並無私立大學，經詢教育部說明選定此4校理由，略以：第2期全校型計畫計有13校提出申請，經專家學者之書面及簡報審查，委員共識認為臺大等4校於學術研究、人才培育及延攬均有相當成果，其他學校在學術能量較前開4校仍有相當落差，爰補助4校推動全校型計畫，提升國際學術影響力。鑒於高教深耕計畫第2期預計挹注256.6億元辦理全校型計畫，允宜適度揭露評比機制及選定之具體理由，並滾動檢討其於學術創新研發、人才培育延攬、國際影響力提升及社會責任貢獻等面向之辦理績效，俾協助大學建立國際領先之優勢地位。
(二)大專校院及研究中心優秀人才在論文引用及影響力等方面，仍有提升之空間
1.特色領域研究中心第1期執行成果亮點：計畫聚焦優勢「特色研究」領域，集中資源強化大學利基強項之研究能量，培育重點產業領域人才，解決社會議題，提升產業競爭力。第1期執行成果亮點之量化成果如表3-2-4。
表3-2-4 高教深耕計畫第1期研究中心計畫執行成果亮點(量化成果)
量化成果
單位
107年
108年
109年
110年
111年
延攬高階研發人才
人次
785
855
1,074
1,408
914
邀請國際優秀人才之情形
人次
774
970
249
212
337
培養年輕學者或博士生具國際研究經驗之情形
人次
688
1,067
569
753
671
研究中心成員具影響力之論文數及影響力成長情形
篇數、百分比
1,860篇WoS論文、
Q1占比為61.17%
2,599篇WoS論文、
Q1占比為63.20%
2,295篇WoS論文、
Q1占比為59.76%
3,001篇WoS論文、
Q1占比為57.51%
2,289篇WoS論文、
Q1占比為58.47%
研究成果對產業或社會發展之貢獻件數及金額
件數、新臺幣億元
580件、
總金額為10.1億元
913件、
總金額為13億元
1,180件、
總金額為16.5億元
1,071件、
總金額約12.2億元
916件、
總金額約12.1億元
說 明：WoS係Web of Science資料庫之簡稱；Q1占比係發表在影響係數前25%之西文期刊比率。
資料來源：教育部(113年5月6日)提供。
2.特色領域研究中心計畫共補助24校76案：審查重點包括目標設定之合理性及積極度、重大研究成果及其對社會與產業之貢獻、人才培育、學術研究（一般大學）、產學合作表現(技專大學）、國際合作交流及社會貢獻等面向的策略與執行成效、資源(包含研究空間、設備、人員)整合、分配與外部連結之策略與過去成效、在解決國家重大議題或發展重點產業技術所訂目標之積極度及所訂策略之有效性、經費規劃之合理性。
3.臺灣在「全球前2% 頂尖科學家榜單」及「全球高被引學者」之表現，仍有提升論文影響力之空間：
(1)美國史丹福大學專家經由全球最大論文索引摘要資料庫Scopus發表112年「全球前2%頂尖科學家榜單(World’s Top 2% Scientists 2023)」，在「終身科學影響力排行榜」入榜前2%科學家國家分布，臺灣入榜學者1,669位，排名維持第19名，雖較去年增加5%，在亞洲排名仍落後於中國大陸(4)、日本(6)、印度(14)及韓國(17)；另在112年全球Top 2% 終身科學影響力排行榜，臺灣進入2%學者最多之前25所學校中，雖以國立大學居多，而科技大學及私立大學亦有入榜(詳表3-2-5)。
表3-2-5 112年全球Top 2% 終身科學影響力之學者-臺灣25所學校入榜概況表
單位：人
排名
學校名稱
112年學校入榜研究者數
111年學校入榜研究者數
排名
學校名稱
112年學校入榜研究者數
111年學校入榜研究者數
1
國立臺灣大學
220
209
14
逢甲大學
24
21
2
國立成功大學
152
139
15
淡江大學
23
23
3
國立陽明交通大學
121
114
16
中原大學
21
21
4
國立清華大學
94
89
17
高雄醫學大學
20
18
5
國立臺灣科技大學
55
49
18
國立臺灣師範大學
19
14
6
國立中興大學
53
48
18
國立雲林科技大學
19
23
7
國立中央大學
44
45
20
元智大學
18
15
7
國立中山大學
44
45
21
國立中正大學
16
15
9
長庚大學
42
45
21
臺北醫學大學
16
21
9
國立高雄科技大學
42
35
23
國立聯合大學
14
13
11
中國醫藥大學
36
30
24
亞洲大學
13
16
12
國立臺北科技大學
27
26
24
國立彰化師範大學
13
12
12
國立臺灣海洋大學
27
22
-
資料來源：113年1月8日，ELSEVIER網站(113年5月14日檢索)。
(2)另科睿唯安(Clarivate)科學資訊研究所對WOS資料庫SCIE及SSCI收錄期刊中高被引論文數據進行評估整理，發布「全球高被引學者(Highly Cited Researchers)」名單，旨在表彰對所在學科做出重大貢獻之具有全球影響力之自然科學家和社會科學家，112年度共有全球67個國家和地區，1,300多個機構6,849名研究人員，共7,125人次入選全球高被引學者名單，美國及中國大陸入榜人次分居首及次位，臺灣機構上榜學者計18人(詳表3-2-6)，臺灣於「全球前2%頂尖科學家榜單」及「全球高被引學者」之表現，論文影響力仍有提升空間。
表3-2-6 112年度全球高被引學者名單-臺灣機構上榜統計表
單位：人
序號
機構名稱
上榜學者人數
序號
機構名稱
上榜學者人數
1
國立臺灣大學
6
6
奇美醫院
1
2
淡江大學
2
7
國立中山大學
1
3
國立成功大學
2
8
國立清華大學
1
4
國立臺灣科技大學
2
9
亞洲大學
1
5
中央研究院
1
10
中國醫藥大學
1
資料來源：淡江時報第1174 A期、科睿唯安網站「科睿唯安發佈2023年度『全球高被引學者』名單，遴選高影響力科學人才」。