交通部106年度「鐵路建設計畫」預算數94億1,900萬元，決算實現數64億8,000萬6千元、應付數4,314萬7千元、保留數6億2,092萬8千元，合計決算數71億4,408萬2千元，占預算數75.85%，賸餘22億7,491萬8千元，共辦理14項鐵路建設計畫，其中市區鐵路地下化或高架化計畫占6項(詳附表1)。經查：
附表1：迄106年度市區鐵路地下化或高架化計畫之預算編列及執行概況 單位：新臺幣千元
計畫名稱
計畫總經費
(中央編列)
迄106年度預算編列及執行情形
計畫執行
進度
累計
預算編列數
累計
執行數
執行率%
預定%
實際%
臺中都會區鐵路高架捷運化計畫
30,809,346
(28,831,346)
26,290,822
26,041,889
99.05
93
92
高雄市區鐵路地下化計畫
71,582,351
(50,298,875)
26,543,526
26,543,526
100.00
100
98
高雄鐵路地下化延伸鳳山計畫
17,625,381
(12,400,541)
5,041,500
5,041,500
100.00
93
92
高雄鐵路地下化延伸左營計畫
10,661,697
(7,568,500)
6,153,900
5,890,556
95.72
100
98
臺南市區鐵路地下化計畫
29,359,862
(25,689,879)
1,832,037
1,436,046
78.39
15
15
嘉義市區鐵路高架化計畫
23,898,000
(20,065,000)
87,000
631
0.73
1
1
合計
183,936,637
65,948,785
64,954,148
※註：1.資料來源，交通部106年度單位決算，本報告整理。
2.執行數含實現數、應付數及賸餘數。
(一)部分計畫累計預算執行率未達8成
1.臺南市區鐵路地下化計畫：累計預算執行率(累計執行數占累計預算編列數之比率，以下同)為78.39%(詳附表1)，主要係因民眾抗爭，致北區、東區土地協議價購及地上物拆遷作業較預計期程落後所致。審計部於106年度中央政府總決算審核報告指出，該計畫項下部分土建標所需用地涉及私有地拆遷，惟交通部鐵路改建工程局(於107年6月11日與高速鐵路工程局整併為鐵道局)未於發包前完成施工用地取得，且部分施工路段已逾契約規定用地交付期限，影響工程施工進度，請交通部督促檢討改善。
2.嘉義市區鐵路高架化計畫：累計預算執行率為0.73%(詳附表1)，係因該計畫之綜合規劃原預計於年中核定，嗣於106年9月始核定，爰相關作業期程順延，影響後續工程細部設計技術服務發包進度，截至106年底已完成工程設計及監造合約簽訂、委託嘉義市政府代辦「都市縫合先期規劃及變更都市計畫」行政契約，刻正辦理簽約程序、臨時軌工程發包及先期工程動工等。
(二)部分計畫多次展延期程
1.臺中都會區鐵路高架捷運化計畫：該計畫於95年2月核定，原訂完工期程為103年2月。因建造型式整合、都市計畫變更、地方民意需求、法規變更、物價調整、車站造型審議、建照核發、地下文化遺址等因素，業於101年3月及105年12月2次變更計畫，期程各展延至106年3月及108年1月。
2.高雄市區鐵路地下化計畫：
(1)該計畫於95年1月核定，原訂期程至104年12月。因都市計畫變更、增設通勤站、增設新左營站場、法令變更等因素，於98年2月第1次變更計畫，調增計畫經費至718.61億元，期程展延至106年12月；復因用地取得受阻、中油管遷延宕、承商解約及車站造型變更等因素，並整併左營及鳳山計畫，於106年12月第2次變更計畫，並將名稱修正為「高雄市區鐵路地下化計畫(含左營及鳳山）」。
(2)整併後總經費998.69億元不變(含園道建置工程費42.34億元)，由中央政府負擔702.68億元、高雄市政府負擔250.84億元，高雄市政府捷運局負擔45.17億元，第一階段鐵路地下化通車以107年8月為目標(業於107年10月通車)，整體計畫(包含第二階段地面建築設施等相關工程)期程調整至通車後5年(預定112年度)。
綜上，交通部「鐵路建設計畫」106年度編列6項市區鐵路地下化或高架化計畫，部分計畫因民眾抗爭影響用地取得或計畫核定較遲致相關作業期程順延，預算執行未如預期，另部分計畫多次展延期程，允宜強化控管並妥為協調溝通，俾利後續工程如期執行。