由於花東地區地理環境適合發展有機農業，爰中央政府於96年即依行政院核定之東部永續發展綱要計畫(96至104年)，輔導花東地區推動有機農業，嗣於102年起配合花東地區發展條例之實施，納入花東綜合發展實施方案辦理並訂定「花東地區有機農業發展計畫」，計畫期程105至110年度，預計由農委會農糧署公務預算編列8.40億元，以擴大花東地區有機農業之生產量能，並以迄110年底花東地區有機生產總面積達5,000公頃；友善生產面積達1,000公頃；有機農產品產值達45.13億元；倉儲物流、加工及地產地消數量達6,000公噸；東部有機休閒旅遊體驗人數達60萬人次；東部有機消費之服務所得達4.50億元；花東有機及相關產業累計就業人次達19萬2千人次等7項為該計畫執行之績效目標值。依農委會所提供資料，迄108年度花東地區有機農業發展計畫共編列預算5.266億元(較計畫原訂5.60億元減少0.334億元)，決算4.541億元(詳附表3-2)，預算執行率86.23%，主要係因該計畫預算部分需配合花東地區永續發展基金計畫提列配合款，惟因花蓮縣及台東縣政府執行率不佳，連帶影響中央主管機關所應提列配合款之執行成效；另該計畫執行至108年底，仍有部分績效未達目標值(詳附表3-3)，尚待加強辦理。
附表3-2：105至108年度花東地區有機農業發展計畫各工作項目預算與決算概況表 單位：新台幣億元
工作項目
年度經費需求
105年度
106年度
107年度
108年度
105-108年度合計
預算
決算
預算
決算
預算
決算
預算
決算
預算
決算
推展集團栽培，擴大有機生產面積
0.500
0.500
0.398
0.167
0.393
0.344
0.150
0.150
1.441
1.161
發展區域型有機理貨及加工價值鏈
0.300
0.300
0.200
0.100
0.300
0.200
0.150
0.100
0.950
0.700
輔導建構現代化倉儲物流體系及推動地產地消
0.350
0.350
0.300
0.150
0.300
0.300
0.270
0.225
1.220
1.025
建構原鄉部落有機農業及低碳、永續環境
0.150
0.150
0.150
0.150
0.150
0.150
0.150
0.150
0.600
0.600
營造東部有機健康樂活廊道
0.100
0.100
0.100
0.100
0.150
0.150
0.130
0.130
0.480
0.480
強化有機試驗示範場域及建立有機農業設施典範
0
0
0.200
0.200
0.050
0.050
0.325
0.325
0.575
0.575
合 計
1.400
1.400
1.348
0.867
1.343
1.194
1.175
1.080
5.266
4.541
資料來源：農委會提供。
附表3-3：105至108年度花東地區有機農業發展計畫績效目標值與實際值概況表
項 目
衡量標準
103基期年
105-106年
107-108年
目標值
實際值
目標值
實際值
擴大花東地區有機生產面積
公頃
(累計)
1,755
2,755
2,192
3,855
3,047
擴大花東地區友善生產面積
公頃
(累計)
0
500
203
750
1,034
有機農產品產值
產值
(億元)
10.33
16.33
12.99
28.03
29.66
推動倉儲物流、加工及地產地消數量
公噸
400
1,000
800
3,000
3,000
提升東部有機休閒旅遊體驗人數
萬人次
(累計)
3
10
10
30
10
東部有機消費之服務所得
億元
1
1.6
1.2
2.8
2.9
花東有機及相關產業就業人次
千人次
(累計)
18
48
38.4
108
112.8
資料來源：表列績效指標項目、衡量標準及目標值均摘自106年4月之「花東地區有機農業發展計畫核定本」(105至110年度)，實際值部分為農委會提供，其中「擴大花東地區有機生產面積」107-108年之實際值，係摘自農委會農糧署官網統計資料中迄108年底花蓮與臺東兩縣有機種植面積之總和。