為增進我國研發創新及產業技術能量，按科學技術基本法第3條：「政府應於國家財政能力之範圍內，持續充實科學技術發展計畫所需經費。…。」等規定，中央政府長期持續投入鉅額科技經費。105至108年度我國整體科技經費預算介於932.08億元至1,027.90億元間(詳附表2–1)，107、108年度科技經費相較前幾年度略減；倘以主管機關觀之，108年中央政府科技經費總計946.51億元，其中科技部388.33億元(占比41.0%)、經濟部271.22億元(占比28.7%)為最高。
附表2-1：近年中央政府科技經費概況表 單位：新臺幣百萬元
機關/
年度
105
106
107
108
金額
占比%
金額
占比%
金額
占比%
金額
占比%
整體科技預算
102,148
100.0
102,790
100.0
93,208
100.0
94,651
100.0
科技部
39,262
38.4
36,820
35.8
36,479
39.1
38,833
41.0
經濟部
29,973
29.3
27,743
27.0
27,093
29.1
27,122
28.7
中央研究院
11,532
11.3
11,411
11.1
11,418
12.3
11,018
11.6
衛生福利部
4,656
4.6
4,778
4.6
4,907
5.3
4,667
4.9
農委會
4,087
4.0
4,293
4.2
4,308
4.6
4,326
4.6
教育部
1,680
1.6
1,608
1.6
1,494
1.6
1,540
1.6
其他部會
10,958
10.8
16,137
15.7
7,509
8.0
7,145
7.6
說明：表內「其他部會」包括國家科學技術發展基金管理會(跨部會署科技計畫)。
資料來源：整理自行政院主計總處「我國中央政府科技經費預算」，109年5月11日查詢結果。
而經濟部及所屬科技經費以該部技術處、工業局為大宗，其中投入我國產業創新研發價值並引領產業創新轉型與發展模式部分，主要係由該部技術處負責；工業局、商業司及中小企業處等單位，則協助產業界量產產品或服務，促進產業轉型及升級。按經濟部提供105至109年度該部及所屬科技經費預算概況，其中以技術處推動法人、業界及學界等三大科技專案計畫為大宗，每年度均逾140億元，占經濟部及所屬科技預算比率五~六成；其次則為工業局、中小企業處之科技預算等(詳附表2–2)。
此外，經濟部及所屬科技預算如以配置用途觀之，108、109年度以「業界量產及輔導」最高，「法人研發」則次之；另106年度起配合政府5+2產業創新政策，經濟部及所屬科技預算用於5+2產業創新相關計畫，占該部及所屬整體科技預算平均逾六成(詳附表2–3、2–4)。
附表2-2：近年經濟部及所屬科技預算概況表 單位：新臺幣億元
單位/
年度
105
106
107
108
109
金額
占經濟部主管科技預算比率
金額
占經濟部主管科技預算比率
金額
占經濟部主管科技預算比率
金額
占經濟部主管科技預算比率
金額
占經濟部主管科技預算比率
技術處
182.56
60.9%
163.57
59.0%
158.05
58.3%
147.96
54.6%
148.97
54.8%
工業局
82.10
27.4%
80.20
28.9%
72.65
26.8%
78.80
29.1%
79.73
29.3%
商業司
8.52
2.8%
8.58
3.1%
7.24
2.7%
6.65
2.5%6.26
2.3%
中小企業處
13.69
4.6%
11.96
4.3%
17.12
6.3%
19.98
7.4%
20.00
7.4%
能源局
-
0.0%
0.87
0.3%
2.89
1.1%
2.49
0.9%
2.23
0.8%
標準檢驗局
5.13
1.7%
4.64
1.7%
5.20
1.9%
7.07
2.6%
6.99
2.6%
其他
7.72
2.6%
7.62
2.7%
7.77
2.9%
8.28
3.1%
7.74
2.8%
經濟部合計
299.73
100.0%
277.43
100.0%
270.93
100.0%
271.22
100.0%
271.91
100.0%
資料來源：經濟部109年6月提供。
附表2-3：近年經濟部及所屬科技預算用途配置概況表
單位：新臺幣億元
單位/年度
105
106
107
108
109
金額
占經濟部主管科技預算比率
金額
占經濟部主管科技預算比率
金額
占經濟部主管科技預算比率
金額
占經濟部主管科技預算比率
金額
占經濟部主管科技預算比率
法人
研發
147.54
49.2%
127.95
46.1%
130.10
48.0%
115.49
42.6%
115.11
42.3%
業界產量及輔導
123.12
41.1%
121.81
43.9%
113.00
41.7%
124.94
46.1%
127.19
46.8%
學界產業合作
4.87
1.6%
4.62
1.7%
4.45
1.6%
4.73
1.7%
4.3
1.6%
其他
24.20
8.1%
23.05
8.3%
23.38
8.6%
26.05
9.6%
25.31
9.3%
經濟部合計
299.73
100.0%
277.43
100.0%
270.93
100.0%
271.22
100.0%
271.91
100.0%
資料來源：經濟部109年6月提供。
附表2-4：近年經濟部及所屬科技預算配置(非)5+2產業創新產業表
單位：新臺幣億元
單位/
年度
106
107
108
109
金額
占經濟部主管科技預算比率
金額
占經濟部主管科技預算比率
金額
占經濟部主管科技預算比率
金額
占經濟部主管科技預算比率
5+2產業創新預算
163.03
58.8%
166
61.3%
174.07
64.2%
181.48
66.7%
非5+2產業創新預算
114.40
41.2%
104.93
38.7%
97.15
35.8%
90.44
33.3%
經濟部合計
277.43
100.0%
270.93
100.0%
271.22
100.0%
271.91
100.0%
資料來源：經濟部109年6月提供。