依中央政府特種基金參加民營事業投資管理要點第11點規定：「基金參加民營事業投資所營事業目標無法達成，或連續3年虧損情況無法改善，應詳加評估檢討，報由主管機關核處。」各主管機關對所投資公私合營事業有連續營運虧損情形者，應詳加檢討與評估，並報由主管機關核處。經查：
(一)各主管機關有部分投資事業已連續虧損多年，或營運虧損逐年擴大情形
參據各主管機關提供截至108年底止轉投資公私合營事業近3年度(106年度至108年度)有2年以上(含)營運虧損情形之彙總。各該機關投資事業有營運績效持續欠佳者，包括：
1.行政院國發基金管理會主管部分
國發基金轉投資事業於106年度至108年度間有2年以上(含)營運虧損家數總計21家(詳附表15)，其中：
(1)連續虧損7年：藥華醫藥公司、中裕新藥公司、台康生技公司與國光生物科技公司等4家於102年度至108年度均為營運虧損狀態。詢據該會說明，藥華醫藥公司仍在新產品研發階段、中裕新藥公司因多數新藥仍處研發階段及委託生產製程不順而毛利偏低、台康生技公司及國光生物科技公司則分別尚處研發階段與建置填充生產線階段等原因，致各公司營運均連年虧損。
(2)連續虧損5年：聯亞生技開發公司及台灣花卉生物技術公司於104年度至108年度均為營運虧損狀態，前者因持續投入新藥研發經費而虧損數年，後則為所投資子公司虧損嚴重而認列投資損失；後者因全球花卉及茶葉市場面臨激烈價格競爭，及越南子公司有茶樹受病蟲害及老化等影響，致公司整體營業績效未如預期。
(3)連續虧損3年：有台灣國際造船公司、Gogoro Inc.、聯合再生能源公司與理想大地公司等4家於106年度至108年度均為營運虧損狀態，其中台灣國際造船公司因未能承攬有利潤之商船業務等與業務成本增加所致連續虧損；Gogoro Inc.則因資本支出較大且持續開發新產品，仍處於虧損狀態；聯合再生能源公司為107年10月新日光、昱晶及昇陽光電等3家公司合併後，因受全球太陽能電池巿場供過於求、模組因台灣市場太陽能政策不明朗及新興市場開發進度延後等影響，營收未如預期，108年度營運虧損已擴增至57.69億元；理想大地公司主要因花蓮地區新開多家渡假飯店而遭分食市場，及受年金改革影響退休族群消費意願與陸客減少等因素所致。
(4)營運虧損逐年擴大甚或破產：有華擎機械工業公司、台杉水牛投資公司、台杉水牛二號生技創投有限合夥、三顧公司與寶德電化材料科技公司等5家營運虧損逐年擴大，其中華擎機械工業公司受限國內汽車市場景況及拓展國外市場困難，未達經濟規模，引擎產銷量減少而致虧損擴大；台杉水牛投資公司與台杉水牛二號生技創投有限合夥因各於106年12月及107年7月成立，實際運作時間較短，目前尚無轉投資事業可供出售，致營運仍為虧損狀態；三顧公司因生醫部門尚屬研發階段，營運損益則由106年度淨利518.9萬元逐步惡化至108年度淨損1.09億元；而寶德電化材料科技公司(資本額141.8億元)為生產太陽能原料多晶矽事業，因受太陽能產業低迷與太陽能多晶矽價格暴跌影響，不堪連年營運虧損，業於109年2月聲請破產，國發基金持股比率為11.18%(另有經濟部主管之耀華玻璃持股11.18%)，政府投資損失甚鉅。
附表15：國發基金轉投資公私合營事業106-108年度虧損達2年(含)以上者彙總表 單位：新台幣千元
公私合營事業
本期淨損
連續虧損緣由
106年度
107年度
108年度
藥華醫藥公司
-872,308
-1,039,760
-842,994
進行較多新產品研發計畫，致持續產生虧損。
中裕新藥公司
-524,554
-321,710
-578,654
多數新藥仍處研發階段，另委託生產製程不順。
台康生技公司
-174,855
-367,788
-860,925
公司尚在研發階段
國光生物科技公司
-781,086
-617,843
-280,678
公司尚在建置填充生產線
聯亞生技開發公司
-766,490
-966,684
-1,150,750
前因新藥研發經費持續擴大損失，後又為子公司虧損而認列投資損失。
台灣花卉生物技術公司
-27,750
-67,700
-22,039
市場價格競爭激烈且越南子公司營運未如預期，影響獲利。
台灣國際造船公司
-5,883,199
-3,100,084
-1,815,518
因匯損、商船及巡防救難艇成本增加、未能承攬有利潤之商船及軍艦業務未如期開標等所致。
Gogoro Inc.
-2,780,924
-1,236,044
-277,494
資本支出較大且持續開發新產品，仍於虧損階段。
聯合再生能源公司
-4,159,989
-605,168
-5,769,189
107年由新日光等3公司合併後，因市場供過於求、太陽能政策不明朗及新興市場開發進度延後影響營收。
理想大地公司
-68,678
-70,369
-40,465
市場遭分食及退休族群與陸客減少等因素所致。
華擎機械工業公司
5,676
-57,045
-155,080
受限國內汽車市場景況及拓展國外市場困難，未達經濟規模，引擎產銷量減少。
台杉水牛投資公司
-5,102
-98,308
-101,670
實際運作期間僅2年，尚無轉投資事業可供出售。
台杉水牛二號生技創投有限合夥
-
-61,570
-143,467
實際運作期間僅1.5年，尚無轉投資事業可供出售。
三顧公司
5,189
-57,744
-108,672
生醫部門尚屬研發階段
寶德電化材料科技公司
-589,463
-1,565,744
na
公司破產中
達輝光電公司
-511,541
-275,527
42,587
TAC膜第2條生產線開始量產獲利，108年轉虧為盈。
太景醫藥研發控股公司
746,378
-343,210
-194,533
多數新藥仍處研發階段，營收不足支付研發支出。
全球創業投資公司
0.16
-0.23
-2.20
因釋股量減少，影響營收。
東貝光電科技公司
-1,840,839
75,420
na
公司尚在轉型階段
利翔航太電子公司
-24,288
-6,133
2,957
調整業務方向投入許多研發經費，惟未能產生效益造成營收下滑。
陽明海運公司
491,866
-6,306,356
-3,997,896
全球航運供需失衡，運價無法有效提升所致。
※註：1.資料來源，國家發展委員會提供。
2.財政部主管部分
106年度至108年度計有2家公司連續3年營運虧損(詳附表16)，其中臺灣中華日報社公司因現實環境不利平面媒體經營，廣告量減少致獲利欠佳，陷於連年營運虧損困境；而臺灣行動支付公司則因建置平台、優化APP及提供優惠方案等措施，致成本增加而發生虧損。另國際建築經理公司因幾無營業，淨值已呈大幅負數，以借貸維持營運，營業收入不足支應利息及薪資費用，致連年虧損；臺灣金融聯合都市更新服務公司於107 年 3 月發起設立，尚處營運初期，營業收入不足以分攤成本，營運虧損由107年度之3,019.5萬元增至108年度之7,552.7萬元。
附表16：財政部轉投資公私合營事業106-108年度虧損達2年(含)以上者彙總表 單位：新台幣千元
公私合營事業
本期淨損
連續虧損緣由
106年度
107年度
108年度
臺灣中華日報社公司
-16,498
-37,306
-35,275
環境不利事業經營且廣告量減少致獲利欠佳。
臺灣行動支付公司
-63,606
-27,990
-28,760
因建置平台、優化APP及提供優惠方案等增加成本而致虧損。
國際建築經理公司
-6,403
-3,063
未提供
幾無營業，營業收入不足支應利息及薪資費用。
臺灣金融聯合都市更新服務公司
-
-30,195
-75,527
尚處營運初期，營業收入不足以分攤成本。
※註：1.資料來源，財政部提供。
3.經濟部主管部分
106年度至108年度計有5家公司連續3年營運虧損(詳附表17)，及8家公司於3年內有2年為營運虧損情形。連年虧損事業包括：中殼潤滑油公司與台灣絲織開發公司連續虧損7年、台灣花卉生物技術公司與聯亞生技開發公司連續虧損5年、台灣國際造船公司連續虧損4年。其中中殼潤滑油公司已關廠結束營業，目前進行土壤及地下水污染整治工作；台灣絲織開發公司因所剩未售地(學校用地等)有限且不易出售，主要收入仰賴竹圍子區淨、污水廠營運收入，惟仍入不敷出而致連續虧損；台灣花卉生物技術公司因越南子公司茶樹老化及病蟲害等因素，致營業績效未如預期；聯亞生技開發公司因研發費用有效降低，個體財務已轉虧為盈，惟依權益法認列聯亞藥及聯生藥2家子公司投資損失，致生虧損；台灣國際造船公司因受匯率變動及工程進度推展不順等影響，成本增加所致連年虧損。
又部分事業營運虧損有急遽惡化情形，如華擎機械工業公司107年度由盈轉虧0.57億元後，108年度淨損遽增至1.35億元，主要受汽車產業景氣影響，汽車引擎銷售未如預期及相關開發計畫減少所致；華威公司107年度亦由盈轉虧1.58億元後，108年度淨損再增至2.27億元，係106年底結束承運天然氣長約，主要係因船型老舊、航運市場景氣不佳，無法取得長期租約而產生虧損；依序思公司108年度由盈轉虧，淨損達109.42億元，主要為107年11月開始投產商轉，因油價偏低，且面臨貸款償還及付息壓力所致。另越南宏越責任有限公司與臺灣風能訓練公司108年度營運虧損均較107年度惡化，前者因尚處建廠階段而無收入，後者則因設立初期之硬體設備與訓練設施建置而致虧損增加。
附表17：經濟部轉投資公私合營事業106-108年度虧損達2年(含)以上者彙總表 單位：新台幣千元
公私合營事業
本期淨損
連續虧損緣由
106年度
107年度
108年度
中殼潤滑油公司
-15,305
-13,014
-12,791
已關廠結束營業，刻進行土壤及地下水污染整治工作。
台灣絲織開發公司
-32,862
-29,304
-22,006
收入仰賴竹圍子區淨、污水廠營運收入，惟入不敷出而虧損。
台灣花卉生物技術公司
-27,750
-67,700
-22,039
越南子公司茶樹老化及病蟲害等因素，營業未如預期。
台灣國際造船公司
-5,883,199
-3,100,084
-1,815,518
匯率變動及工程進度推展不順，成本增加所致。
聯亞生技開發公司
-766,490
-966,684
-1,150,750
因認列2家子公司投資損失所致營運虧損。
華擎機械工業公司
5,676
-57,045
-155,080
汽車引擎銷售未如預期及相關開發計畫減少所致。
華威公司
817,853
-157,916
-227,114
106年底結束承運天然氣長約卻未取得其他長期租約。
依序思公司
-654,563
11,343
-10,941,792
107年11月始投產商轉，因油價低及還款息重致虧損。
越南宏越責任有限公司
-12,208
135,019
-19,674
處建廠階段，尚無營業收入。
臺灣風能訓練公司
-
-6,383
-8,283
公司107年5月設立，初期因硬體設備及訓練設施陸續建置，開課種類及數量受限，仍在虧損階段。
曄揚公司
-15,749
-750,362
16,859
股東已決議終止推動建廠，辦理解散中。
太景醫藥研發控股公司
746,378
-343,210
-295,685
新藥權利金收入尚無法支應研發費用，致產生虧損。
第五期生物技術發展基金 VVF V
-3,195
(美元千元)
-6,433
(美元千元)
1,933
(美元千元)
尚未處分股票評價降低，致產生虧損，虧損額度屬未實現股票帳面價值衡量損失(各投資標的之市值與前年度之差額)。
※註：1.資料來源，經濟部提供，均為股份有限公司。
4.交通部主管部分
106年度至108年度計有2家公司連續3年營運虧損(詳附表18)，分別為亞太電信公司與臺灣行動支付公司；另有2家公司連續2年營運虧損，各為陽明海運公司與臺灣風能訓練公司。其中亞太電信公司已連續6年營運虧損，108年度淨損金額再擴增至51.62億元，因持續投入4G基站優化相關建設，再加上4G頻譜標金攤提費用，108年度折舊攤提費用為60億元，致虧損額度再增；臺灣行動支付公司於募資時即預估初期4年將有虧損，第5年始能轉虧為盈，第7年方得彌平累積虧損，108年為第5年營運，經營結果與107年度相當。又陽明海運公司因市場運價不如預期，加上提列負債準備及新適用租賃會計認列額外利息支出等，致年度合併損失40億元；臺灣風能訓練公司於107年5月成立，主要因風電開發商受躉售電價調整影響，延後開發建置期程，致人員訓練課程需求遞延，影響108年度營運績效。
附表18：交通部轉投資公私合營事業106-108年度虧損達2年(含)以上者彙總表 單位：新台幣千元
公私合營事業
本期淨損
連續虧損緣由
106年度
107年度
108年度
亞太電信公司
-4,034,616
-3,267,731
-5,161,872
4G基站優化相關建設及4G頻譜標金攤提費用，入未敷出。
臺灣行動支付公司
-63,606
-27,990
-28,760
原規劃預估即第5年(108年度)營運始能轉虧為盈。
陽明海運公司
491,866
-6,306,356
-3,997,896
市場運價不如預期及相關認列支出，致持續虧損。
臺灣風能訓練公司
-
-6,383
-8,283
受風電躉售電價調整而延後開發建置期程，致訓練課程需求遞延，營運績效不如預期。
※註：1.資料來源，交通部提供，均為股份有限公司。
5.國軍退除役官兵輔導委員會主管部分
106年度至108年度計有2家公司連續3年營運虧損（詳附表19），分別為歐欣環保公司與達榮環保公司，前者成立迄今尚未正式營運，雖已辦理鑑價，惟為配合行政院政策，暫緩撤資，俟行政院政策決定後再配合辦理；後者主要營業事項因雲林縣政府片面終止合約未能成就，尚無法移交資產且持續負擔維護費用以致虧損。另有泛亞工程公司已連續2年營運虧損，主要係部分工程案件執行虧損所致。
附表19：退輔會轉投資公私合營事業106-108年度虧損達2年以上(含)者彙總表 單位：新台幣千元
公私合營事業
本期淨損
連續虧損緣由
106年度
107年度
108年度
歐欣環保公司
-11,492
-13,894
-11,143
尚未正式營運，無營收卻需支付相關事物與人事成本。
達榮環保公司
-17,148
-10,004
-9,885
因與雲林縣政府契約爭議，無法移交資產且持續負擔維護費用。
泛亞工程公司
57,009
-246,324
-122,485
部分工程案件虧損。
※註：1.資料來源，退輔會提供，均為股份有限公司。
(二)各公私合營事業營運虧損多年之緣由不一，各主管機關允宜積極透過公股管理督促事業注意績效改善，俾維護投資權益
衡酌前揭各事業多年營運虧損或營運虧損逐年擴增之緣由不一，各主管機關允宜就產業性質與導致營運虧損因素，個案檢討並透過公股管理督促事業注意與改善，概析如次：
1.產業週期特性：如生技製藥產業初期之研發經費較高且週期較長，事業恐有多年營運虧損，政府為扶持國內生技產業，透過國發基金長期投資挹注多家事業，惟部分公司投資已近20年卻仍處於連續虧損狀態，如聯亞生技開發公司(87年10月投資迄今)與國光生技公司(90年3月投資迄今)，基金之產業扶持效能容有再提升空間，並宜適時檢討評估投資案之效益性。
2.營運初期階段：部分事業於營運初期之資本投入較大或業務收入較少，開始數年預估為虧損階段，如國發基金投資之台杉水牛投資公司、台杉水牛二號生技創投有限合夥、Gogoro Inc.；財政部投資之台灣行動支付公司(此交通部亦有參與投資)與臺灣金融聯合都市更新服務公司；經濟部主管與交通部主管共同投資之臺灣風能訓練公司等，各該主管機關允宜透過公股管理，注意各公司所營業務之拓展成效，俾公司儘早轉虧為盈。
3.營業收入未如預期：部分事業受到全球景氣趨弱、產業競爭激烈、產品價格下滑或自身業務拓展未佳而導致業務收入不敷成本支出之連年虧損，如國發基金、交通部與經濟部等投資之陽明海運公司、臺灣花卉生物技術公司、台灣國際造船公司、聯合再生能源公司、華擎機械工業公司、華威公司、亞太電信公司、臺灣絲織開發公司等。各主管機關允宜就各事業營運績效不彰情形，妥適檢討評估投資效益，如續為投資者，允宜強化公股代表積極督促事業經營策略改善之落實。
4.無營業卻持續支出：部分事業已結束營業、尚未營業或無營業，卻仍持續相關支出而致連年虧損，如財政部投資國際建築經理公司、經濟部投資中殼潤滑油公司及曄揚公司、退輔會投資歐新環保公司等，各主管機關允宜儘早完成相關事業結束或撤資事宜，俾有效維護公股投資權益。
5.事業聲請破產中：部分事業營運不力而聲請破產，如國發會投資之寶德電化材料科技公司因累積虧損嚴重，未獲相關資金援助，於109年2月聲請破產，公股鉅額投資恐付諸流水，各主管機關允宜加強產業扶植效能評估，並強化對累積虧損嚴重事業之投資風險控管，期有效控制投資損失程度。