(一)特別收入基金設立概況
109年度中央政府總預算附屬單位預算(非營業部分)，其中總統府主管中央研究院科學研究基金等15個主管機關編製附屬單位預算之特別收入基金計25單位、附屬單位預算之分預算之特別收入基金計28單位(詳附表3)。
附表3：109年度特別收入基金構成體系
主管機關
附屬單位預算
附屬單位預算之分預算
總統府
中央研究院科學研究基金
-
行政院
行政院國家科學技術發展基金、離島建設基金、行政院公營事業民營化基金、花東地區永續發展基金
-
內政部
新住民發展基金、研發及產業訓儲替代役基金、警察消防海巡移民空勤人員及協勤民力安全基金、國土永續發展基金
-
教育部
學產基金、運動發展基金、大專校院轉型及退場基金
-
法務部
毒品防制基金
-
經濟部
經濟特別收入基金、核能發電後端營運基金
經濟特別收入基金包括推廣貿易基金、能源研究發展基金、石油基金、再生能源發展基金。
交通部
航港建設基金
-
原子能委員會
核子事故緊急應變基金
-
農業委員會
農業特別收入基金
農業發展基金、林務發展及造林基金、農業天然災害救助基金、漁業發展基金、農產品受進口損害救助基金、農村再生基金。
勞動部
就業安定基金
勞工權益基金。
衛生福利部
衛生福利特別收入基金
醫療發展基金、全民健康保險紓困基金、藥害救濟基金、菸害防制及衛生保健基金、預防接種受害救濟基金、疫苗基金、食品安全保護基金、社會福利基金、家庭暴力及性侵害防治基金、長照服務發展基金、生產事故救濟基金。
環境保護署
環境保護基金
空氣污染防制基金、資源回收管理基金、土壤及地下水污染整治基金、水污染防治基金、環境教育基金、溫室氣體管理基金。
金融監督管理委員會
金融監督管理基金
-
國家通訊傳播委員會
通訊傳播監督管理基金、有線廣播電視事業發展基金
-
公平交易委員會
反托拉斯基金
-
※註：1.資料來源，109年度中央政府總預算案附屬單位預算及綜計表(非營業部分)之總說明圖1「109年度非營業特種基金構成體系圖」。
(二)特別收入基金近年度財務狀況
1.104年度至108年度決算之基金來源、用途、餘絀與平衡表：104年度至108年度決算，特別收入基金之基金來源由2,377.06億元增加至2,810.36億元，增幅18.23%、基金用途自1,853.76億元增加至2,460.16億元，增幅32.71%，而當期餘絀從523.30億元降至350.21億元，減幅33.10%；解繳國庫由22.94億元減至18.53億元，減幅19.22%；期末基金餘額由4,089.23億元增加至5,785.24億元，增幅41.48%(詳附表4)，資產總額增幅53.00%，負債增幅95.64%。
2.109年度預算較108年度決算增減情形：109年度預算基金來源與用途相抵後賸餘250.79億元，較108年度決算341.06億元減幅26.47%；解繳公庫18.13億元較108年度減幅2.16%，期末基金餘額較108年度減幅1.33%。
附表4：特別收入基金104年度至109年度財務概況表
單位：新臺幣億元；%
年度
科目
104
105
106
107
108
109
基金來源
2,377.06
2,613.65
2,490.84
2,752.83
2,810.36
2,869.07
基金用途
1,853.76
1,903.81
2,283.95
2,248.92
2,460.16
2,618.28
本期餘絀
523.30
709.84
206.89
503.91
350.21
250.79
期初基金餘額
3,588.87
4,089.23
4,780.97
4,968.67
5,453.56
5,620.52
解繳公庫
22.94
18.11
18.52
19.02
18.53
18.13
期末基金餘額
4,089.23
4,780.97
4,969.33
5,453.56
5,785.24
5,853.19
期末基金餘額較上年度增減比率
-
16.92
3.94
9.74
6.08
1.17
年底資產
5,194.48
5,918.07
6,11.54
7,216.00
7,947.50
-
年底負債
1,105.25
1,137.10
1,442.20
1,762.44
2,162.26
-
※註：1.資料來源，104年度至108年度決算係依中央政府總決算暨附屬單位決算及綜計表審核報告、109年度法定預算由行政院主計總處109年7月間提供，本研究整理。