植物防疫檢疫法第20條規定：「輸出植物或植物產品，輸入國要求提出檢疫證明者，輸出人得申請植物檢疫機關檢疫。檢疫機關實施檢疫後，應發給證明。」、「前項檢疫，應在植物檢疫機關內實施。但檢疫機關認有必要時，得在該植物或植物產品所在地實施。」是以，對於我國農產品外銷，倘如輸入國要求提出檢疫證明者，輸出人得申請植物檢疫機關檢疫，檢疫機關實施檢疫後，應依法發給證明；另申請輸出檢疫，並應依據動植物檢疫規費收費實施辦法規定繳交相關規費。經查：
(一)為拓展外銷市場，農委會設置外銷供果園，加強產銷供應鏈管理與外銷果品農藥殘留檢測等事項
農委會為拓展外銷市場，穩定農民收益，選定輔導設置香蕉、鳳梨、芒果、葡萄、梨、椪柑、柳橙、茂谷柑、檸檬、棗、柚、番石榴、木瓜、荔枝、楊桃、釋迦、蓮霧、紅龍果、柿、葡萄柚等20項具競爭力之水果，建立供果園登錄制度，加強產銷供應鏈管理，輔導外銷業者與農民契作生產，提升果品品質以穩定外銷。主要輔導措施包括：
1. 加強外銷供果園供應鏈管理：輔導外銷業者與農民簽訂合作意願書，訂定標準化作業流程，改善供果園環境及產銷設施，輔導果園管理及分級包裝貯運改進，建立由產至銷之完整供應鏈，提昇果品品質。
2. 建置「優質供果園登錄簽審系統及出口同意文件簽審系統」：為便利供果園之登錄、審查與核發出口同意文件，開發「優質供果園登錄簽審系統及出口同意文件簽審系統」，推動香蕉、芒果、木瓜及荔枝等出口日本需出口同意文件之水果通關無紙化之措施。
3.辦理田間管理技術指導及講習會：結合產業輔導需求，配合農時辦理技術講習會，改進栽培管理，宣導病蟲草害安全防治，並由技術服務團辦理供果園現場診斷與改善輔導，追蹤外銷水果到貨品質；並編印水果良好作業規範、主要外銷果樹採後處理專刊，輔導農民依相關規範落實全程品質管理。
4.加強外銷果品農藥殘留檢測：強化溯源管理，導入三級品管制度，強化自主管理與查核監督，於採收前7~15日至供果園採樣進行農藥殘留檢驗；另芒果、荔枝及木瓜等，於蒸熱處理場抽驗，符合規定者始核發出口同意文件，確保果品符合目標市場安全衛生基準。
5. 建置外銷集貨包裝作業示範，輔導與國際接軌：遴選績效良好、行銷能力佳之農民團體，輔導建置貫徹食品安全良好規範之現代化集貨分級包裝場，取得符合國際食品安全系統之驗證，並結合現代化物流服務體系，提升為外銷導向之供貨結構功能。
按農委會提供資料，109年度外銷供果園登錄戶數為1,915戶，面積4,325公頃，相較107年度之3,080戶、面積5,494高峰，109年度登錄戶數及面積均有減少(詳表3-12)。
表3-12 105至109年度我國農產品出口業者實際登錄外銷供果園面積及戶數概況表 單位：公頃；戶
年度
105
106
107
108
109
外銷供果園面積
4,699
4,170
5,494
4,185
4,325
戶數
2,626
2,761
3,080
1,853
1,915
資料來源：農委會110年6月提供。
(二)雖已建置外銷農產品生產追蹤管制系統，並鼓勵業者於供果園自主採樣送驗與派員抽驗等工作，惟近年仍有少數外銷農產品於國外檢疫不通過被退貨，允宜加強提升檢疫與檢驗效能
農委會建置外銷作物生產供應鏈，針對重要外銷市場，實施外銷契作及登錄、產銷履歷與條碼追溯管理制度；並自105年開始整合推動外銷水果三級品質管制，除鼓勵業者於供果園自主採樣送驗及該會派員於蒸熱場抽驗外，並由該會防檢局辦理邊境抽驗。另設置優質蔬菜集團產區，強化衛生安全，辦理農藥殘留自主檢驗，確保農民收益及原料安全供應(近年我國水果及蔬菜農藥殘留自主檢驗結果詳表3-13、表3-14)。
雖然農委會已建置外銷農產品生產追蹤管制系統，並鼓勵業者於供果園自主採樣送驗與派員抽驗等工作，惟由於近年部分國家陸續於進口農產品及水產品發現有新冠肺炎病毒殘留，故各國紛紛強化原有之邊境檢驗檢疫工作，導致我國少數外銷農產品於國外檢疫不通過被退貨，進而影響我國整體農產品形象等事件，例如110年2月25日中國大陸海關總署以截獲檢疫性有害生物為由，突然通知我方自同年3月1日起暫停鳳梨進口，使我國銷中4.6萬公噸鳳梨面臨衝擊。對此，政府除賡續協助擴展中國大陸以外之國際市場，俾分散倚賴單一市場風險外，對於其他如日本、澳洲等各國檢規定、外銷門檻不同，農委會允宜協助外銷業者檢疫所需設備、技術，建立符合檢疫規定包裝集貨場等，並加速推動業者建立符合檢疫規範外銷場域，賡續加強督促提升我國農產品之檢疫與檢驗效能。
表3-13 105至109年度我國水果農藥殘留自主檢驗結果概況表
年度
105
106
107
108
109
供果園採樣(件)
375
604
590
599
600
合格率
87.0%
89.6%
92.7%
94.2%
94.2%
蒸熱場抽驗(件)
786
1,031
1,386
1,210
1,217
合格率
96.0%
97.9%
98.3%
99.8%
99.5%
邊境抽驗(件)
358
381
554
315
337
合格率
93.0%
94.5%
96.3%
96.2%
96.1%
資料來源：農委會110年6月提供。
表3-14 105至109年度我國蔬菜農藥殘留自主檢驗結果概況表
年度
105
106
107
108
109
田間抽檢(件)
636
1012
930
1112
942
合格率
99.5%
99%
99.6
99.7
100
集貨場抽檢(件)
0
9
24
14
7
合格率
0
100%
100%
92.8%
100%
資料來源：農委會110年6月提供。