存保公司自88年7月1日起改採風險差別費率，要保機構之存款保險費，保額內存款採風險差別費率計收保費，俾期能合理反映要保機構之經營風險差異；惟所訂「存款保險費率實施方案」似仍未能合理反映各類金融機構之經營風險差異，以致經營風險相對較高之農、漁會信用部反可適用較低存款保險費率，不利業務永續經營，加以農、漁會部分風險分級指標，遠較其他類體質健全之要保機構(如銀行)為低，卻未能適用較高差別費率，不利真實反映其承擔風險之能力，爰建議存保公司應適時檢討風險差別費率機制妥適性及合理性，建立以資本為基準之風險差別費率評定標準，厚植理賠基金，並提高金融機構風險承擔能力及自律功能。