我國自然及人文之觀光資源豐富且型態多元，其開發管理涉及不同主管機關。經查：
(一)觀光資源型態多元，各由不同主管機關管理，跨部會整合不易
1.觀光行政與管理體系
(1)觀光事業管理之行政體系，在中央係於交通部下設路政司觀光科及觀光局；另6直轄市及縣(市)政府亦設有觀光單位，專責地方觀光建設暨行銷推廣業務(詳圖3-1)。
(2)而為整合觀光事業之發展與推動，行政院指派政務委員擔任跨部會之「行政院觀光發展推動委員會」召集人，交通部觀光局局長為執行長，各部會副首長及業者、學者為委員，觀光局負責幕僚作業。
(3)另在觀光遊憩區管理體系方面，國內主要觀光遊憩資源除觀光行政體系所屬及督導之風景特定區、民營遊樂區外，尚有內政部營建署所轄國家公園、行政院農業委員會所轄休閒農業及森林遊樂區、行政院退除役官兵輔導委員會所屬國家農(林)場、教育部所管大學實驗林、經濟部所督導之水庫及國營事業附屬觀光遊憩地區。
圖3-1 觀光行政體系圖
資料來源：交通部觀光局網站。
2.自然與人文觀光資源主管機關眾多：據「Taiwan Tourism 2030–台灣觀光政策白皮書」分析，我國自然觀光資源管理機關眾多，國家公園、國家級風景特定區、休閒農業區、休閒農場、森林遊樂區及國家農場，分別由內政部營建署、交通部觀光局、農業委員會及國軍退除役官兵輔導委員會等機關管理；而直轄市及縣（市）級風景特定區由地方政府管理。至人文觀光資源，例如博物館、美術館、觀光工廠、商圈、夜市、特色部落與聚落及節慶活動，則分別由文化部、經濟部、原住民族委員會、客家委員會及交通部觀光局等機關管理。顯見我國自然與人文觀光資源之開發管理，涉及諸多主管機關，故建立政府各部會落實觀光主流化之跨部會整合機制或平臺，為順利推動觀光發展之重要課題。
(二)觀光資源盤點整備之跨部會協調合作機制，尚待建立明確定位與管考並落實推動，透過跨域整合之加值，規劃更具深度之旅程，以創造臺灣觀光品牌
1.中央及地方各部門觀光資源之整合協調合作機制尚未建立：關於跨部會協調合作，前開白皮書係就特色鐵道旅遊、陸客來臺觀光、MICE、郵輪觀光、改善穆斯林友善旅遊環境有相關規劃。惟觀光資源管理涉及交通部、內政部、外交部、文化部、國防部、勞動部、經濟部、教育部、衛生福利部、客家委員會、原住民族委員會、海洋委員會、僑務委員會、大陸委員會、國軍退除役官兵輔導委員會、農業委員會及縣市地方政府等（詳表3-1-1），如需該等機關配合推動觀光主流化，對具體階段時程、目標、經費需求規劃及關鍵績效評估指標等，仍待觀光局建立明確之定期跨部會協調合作機制，以有效整合資源推動。
2.跨域主題旅遊產品之整備，亟需仰賴跨部門協調合作機制之順利運作：未來觀光政策策略之一，係觀光資源整合朝向落實在地特色、跨域加值及永續經營之觀念，脫離「蓋硬體拚觀光」之思維，開發潛在觀光資源，開發特色主題旅遊產品，亟需仰賴相關部門之定期制度化協調機制，以共同會商討論與檢討。
綜上，我國觀光資源型態多元，自然與人文觀光資源之管理單位涉及交通部、內政部、外交部、文化部、國防部、勞動部、經濟部、教育部、衛生福利部、客家委員會、原住民族委員會、海洋委員會、僑務委員會、大陸委員會、國軍退除役官兵輔導委員會、農業委員會及縣市地方政府等，為利制度化共同會商討論或檢討主題旅遊產品，及促進觀光措施之推動，該等觀光資源盤點整備之定期跨部會協調合作機制，例如各部會分別之階段時程目標、經費需求及績效評估指標等，允宜明確建立，以俾有效整合資源推動。
表3-1-1 觀光政策白皮書之跨部會配合事項
序號
機關
配合事項
1
交通部
推動郵輪旅遊
打造友善港埠環境
營造國內航線穩定營運環境
促進機場活化、強化機場經營特色
推動鐵道觀光
優化公路景觀
提升整體性的內陸運輸服務
營造智慧旅運服務環境
推動智慧觀光
2
內政部
推動社區觀光
國家公園及國家自然公園之管理，推動永續觀光
強化證照查驗業務
3
外交部
簽證簡化
加強國際宣傳
4
文化部
推動文化觀光
推動文化保存、再造歷史現場
5
國防部
推動戰地觀光
6
勞動部
解決觀光業人才需求
7
經濟部
推動會展觀光
推動觀光工廠輔導計畫
協助糖廠活化轉型
推動商圈輔導計畫
美食國際化
推動溫泉觀光
優化水利設施、連結在地推觀光
8
教育部
辦理修學旅行交流活動
鼓勵國民臺灣巡禮
校外教學
推動運動觀光
9
衛生福利部
推動醫療觀光
10
客家委員會
推動客庄旅遊
11
原住民族委員會
推動部落旅遊
12
海洋委員會
適性發展海洋觀光遊憩產業
13
僑務委員會
強化僑臺商組織聯繫服務
14
大陸委員會
推動陸客來臺觀光
15
國軍退除役官兵輔導委員會
提升國家農場旅遊品質
16
農業委員會
推動特色休閒農業旅遊
自然地景維護保育
永續漁業資源
維護森林遊樂區旅遊品質及旅客安全
運用平地造林成果及林業文化空間推展生態旅遊
推動自然保育觀念
優化自然步道系統
推動阿里山鐵路觀光
17
縣市地方政府
優化景區環境
促進國民旅遊
加強國際宣傳
組織區域聯盟
提升旅運服務
資料來源：「Taiwan Tourism 2030–台灣觀光政策白皮書」附錄三。