我國財政有垂直及水平不平衡並存之現象，補助款係上級政府對下級政府之移轉支付，可改善調整垂直及水平之政府財政不平衡。現行補助款制度主要可分為中央政府對各市縣補助，以及縣對所屬鄉(鎮、市)補助2類。其中中央對各市縣之補助項目及方式係規範於財劃法及補助辦法，至縣對所屬鄉(鎮、市)之補助項目及方式，依財劃法規定由縣政府自行制定，補助款之額度則由上級政府以編列預算之方式補助。現行中央對各市縣補助制度要以：
(一)一般性補助
地制法第69條第1項規定，各上級政府為謀地方均衡發展，對財力較差之市縣應酌予補助。一般性補助款補助事項為相關市縣基本財政收支差短與定額設算之教育、社會福利(以下簡稱社福)、基本設施及平衡預算等補助，爰依該條文第3項及財劃法第30條第2項規定訂定補助辦法，由行政院直接依公式設算。
(二)各部會專案(計畫型)補助款
符合具整體性、示範性、跨縣(市)或配合中央重大政策之計畫型補助款，維持由各部會編列。計畫型補助款特色為補助項目有一定範圍，較能配合執行中央政策，惟有時缺乏客觀與明確之分配及補助標準。
(三)統籌分配稅款及近年分配情形
現行中央統籌分配稅款所移轉之公共資金來源、額度及分配方式，如圖1「現行中央統籌分配稅款分配方式」所示，財源主要來自國稅收入，爰其功能限於辦理垂直財政調整。另現行制度係將各級政府分為四級制，依國稅財源總額之61.76%、24%及8.24%分別配予直轄市、縣(市)及鄉(鎮市)，再以公式分配辦理。因分配方式係先訂3類分配水準差異再進行分配，形成資源集中於都會區，城鄉失衡而有「富都(直轄市)窮縣(市鄉鎮)」之結果，其分配公平性屢遭質疑。
(四)補助款及統籌分配稅款近年分配情形
參據108及109年度各市縣獲配統籌分配稅款及補協助收入情況表(詳表1及表1-1)，108年度6都獲配之統籌分配稅款占歲入決算數比重介於21.45%至25.54%間，補協助收入占歲入決算數比重介於8.08%至31.38%間，統籌分配稅款加計補協助收入占歲入決算數比重介於33.62%至56.61%間；另16縣(市)獲配之統籌分配稅款占歲入決算數比重介於12.78%至24.3%間，補協助收入占歲入決算數比重介於26.48%至78.64%間，統籌分配稅款加計補協助收入占歲入決算數比重介於50.78%至91.42%間。
109年度6都獲配之統籌分配稅款占歲入決算數比重介於18.96%至24.12%間，補協助收入占歲入決算數比重介於9%至39.24%間，統籌分配稅款加計補協助收入占歲入決算數比重介於33.12%至60.42%間；另16縣(市)獲配之統籌分配稅款占歲入比重介於9.23%至23.95%間，補協助收入占歲入決算數比重介於83.44%至29.85%間，統籌分配稅款加計補協助收入占歲入決算數比重介於48.95%至92.67%間。顯示108及109年度整體市縣依賴統籌分配稅款及補協助收入程度均超逾5成。
另以個別市縣而言，109年度6都中臺中市及臺南市等2個直轄市依賴統籌分配稅款及補協助收入程度較108年度提高；另109年度16縣(市)中，有7個縣(市)依賴統籌分配稅款及補協助收入程度超逾歲入之8成，其中有1個縣(市)甚超逾9成，且109年度有10個縣(市)依賴統籌分配稅款及補協助收入程度較108年度提高，顯示部分市縣之自籌財源偏低，致財政自主性不佳，多須仰賴中央挹注。
表1 108年度各市縣獲配統籌分配稅款及補協助收入情況表
單位：新臺幣百萬元；%
市縣別
統籌分配稅款(B)
補協助收入(C)
統籌分配稅款+補協助收入(B+C)
歲入數(A)
統籌分配稅款占歲入數(B/A)
補協助收入占歲入數(C/A)
統籌分配稅款與補協助收入合計占歲入數(D/A)
直轄市
臺北市
43,865
13,875
57,740
171,725
25.54%
8.08%
33.62%
高雄市
33,720
31,178
64,898
154,147
21.88%
20.23%
42.10%
新北市
28,379
29,136
57,515
120,493
23.55%
24.18%
47.73%
臺中市
21,827
27,141
48,969
86,501
25.23%
31.38%
56.61%
臺南市
32,488
29,803
62,291
128,584
25.27%
23.18%
48.44%
桃園市
21,302
22,542
43,844
99,321
21.45%
22.70%
44.14%
小計
181,581
153,676
335,257
760,772
23.87%
20.20%
44.07%
縣(市)
宜蘭縣
3,816
13,912
17,728
24,212
15.76%
57.46%
73.22%
新竹縣
5,137
11,372
16,509
25,707
19.98%
44.24%
64.22%
苗栗縣
5,510
13,112
18,622
24,297
22.68%
53.97%
76.64%
彰化縣
10,197
26,101
36,298
47,242
21.58%
55.25%
76.83%
南投縣
6,034
15,860
21,894
26,599
22.68%
59.63%
82.31%
雲林縣
7,917
23,101
31,018
37,667
21.02%
61.33%
82.35%
嘉義縣
6,477
20,045
26,522
31,425
20.61%
63.79%
84.40%
屏東縣
8,626
26,132
34,758
42,968
20.08%
60.82%
80.89%
臺東縣
4,110
12,000
16,110
18,265
22.50%
65.70%
88.20%
花蓮縣
4,449
13,839
18,288
23,086
19.27%
59.95%
79.22%
澎湖縣
2,011
6,772
8,783
9,805
20.51%
69.07%
89.58%
基隆市
4,491
10,198
14,689
19,902
22.57%
51.24%
73.81%
新竹市
4,842
5,276
10,118
19,925
24.30%
26.48%
50.78%
嘉義市
2,645
6,694
9,339
13,322
19.86%
50.25%
70.10%
金門縣
1,572
4,576
6,148
11,632
13.51%
39.34%
52.85%
連江縣
565
3,479
4,044
4,424
12.78%
78.64%
91.42%
小計
78,399
212,469
290,868
380,479
20.61%
55.84%
76.45%
總計
259,981
366,145
626,126
1,141,251
22.78%
32.08%
54.86%
說 明：108年度為決算數，至數字加總尾數不合係因四捨五入進位。
資料來源：本文整理財政部及主計總處提供資料。
表1-1 109年度各市縣獲配統籌分配稅款及補協助收入情況表
單位：新臺幣百萬元；%
市縣別
統籌分配稅款(B)
補協助收入(C)
統籌分配稅款+補協助收入(B+C)
歲入數(A)
統籌分配稅款占歲入數(B/A)
補協助收入占歲入數(C/A)
統籌分配稅款與補協助收入合計占歲入數(D/A)
直轄市
臺北市
42,088
15,695
57,784
174,481
24.12%
9.00%
33.12%
高雄市
31,595
37,061
68,656
164,285
19.23%
22.56%
41.79%
新北市
28,246
35,312
63,558
140,024
20.17%
25.22%
45.39%
臺中市
20,158
37,349
57,507
95,181
21.18%
39.24%
60.42%
臺南市
32,448
39,341
71,789
137,172
23.66%
28.68%
52.33%
桃園市
21,517
27,704
49,221
113,475
18.96%
24.41%
43.38%
小計
176,052
192,462
368,514
824,617
21.35%
23.34%
44.69%
縣(市)
宜蘭縣
3,965
13,258
17,223
23,425
16.93%
56.60%
73.52%
新竹縣
4,464
12,937
17,401
30,523
14.62%
42.38%
57.01%
苗栗縣
5,511
12,557
18,068
23,994
22.97%
52.33%
75.30%
彰化縣
9,585
24,844
34,429
45,587
21.03%
54.50%
75.52%
南投縣
6,722
16,568
23,290
28,062
23.95%
59.04%
83.00%
雲林縣
7,205
18,699
25,904
32,908
21.89%
56.82%
78.72%
嘉義縣
6,548
18,331
24,879
28,902
22.66%
63.43%
86.08%
屏東縣
8,456
28,386
36,842
44,590
18.96%
63.66%
82.63%
臺東縣
4,417
13,616
18,033
20,696
21.34%
65.79%
87.13%
花蓮縣
4,870
15,118
19,988
24,930
19.53%
60.64%
80.18%
澎湖縣
2,001
6,921
8,922
9,940
20.13%
69.63%
89.76%
基隆市
4,222
10,743
14,965
19,978
21.13%
53.77%
74.91%
新竹市
4,410
6,896
11,306
23,099
19.09%
29.85%
48.95%
嘉義市
2,838
7,605
10,443
14,282
19.87%
53.25%
73.12%
金門縣
1,533
4,928
6,461
9,967
15.38%
49.44%
64.82%
連江縣
464
4,201
4,665
5,035
9.23%
83.44%
92.67%
小計
77,211
215,608
292,819
385,918
20.01%
55.87%
75.88%
總計
253,263
408,070
661,333
1,210,535
20.92%
33.71%
54.63%
說 明：109年度為決算數，至數字加總尾數不合係因四捨五入進位。
資料來源：本文整理財政部及主計總處提供資料。