「精進案」之「精進」二字實為「兵力結構與組織精進」之簡稱，係國防部為貫徹「精兵政策」、落實國防二法立法精神，在「持續精進戰力」之思維與理念下，繼「精實案」之後，為肆應未來防衛作戰需求所進行之另一波編裝調整精簡案。該案在「精簡高司、充實基層」之指導原則下分2階段執行：第1階段自93年1月1日起至94年6月底止，以「精進組織」為目標，精簡國防部高司幕僚組織員額20.1％，並進行軍備體系調整、常備後備分立、建立聯合作戰指揮機制等多項分案計畫，將國軍總員額從「精實案」完成後之38.5萬人調降為29.6萬人。94年7月1日起至99年11月1日止為第2階段，該階段則以「軍事轉型」為主軸，力求在確保基本戰力不墜之前提下，再精簡部分高司、後勤及行政單位，使國軍原5個層級之指揮體系，縮短為「聯合作戰指揮中心」、「戰略執行單位」及「作戰部隊」等3個層級，扁平化指揮層級，同時各軍種司令部不再負作戰指揮之責，並將後勤業務區分為各軍「通用」及「專用」兩部分，分別由聯勤司令部及各軍種負責。在組織簡併及業務簡化之調整下，使國軍總員額再從第1階段終了之29.6萬人再降為27.5萬人，合計「精進案」兩階段之實施計畫共精簡國軍員額達11萬人。