民國87年起我國實施完全設算扣抵方式之兩稅合一制度，主要目的在消除股利所得之重複課稅，以減輕投資者租稅負擔，進而達到鼓勵投資目的；惟兩稅合一制度實施至今，不僅稅收大幅流失，貧富差距加大，且促進投資之效果並不明顯，亦不符合國際稅改趨勢，實有改進必要。
租稅負擔率係衡量政府施政財源穩定程度之重要指標，依財政部統計顯示，我國租稅負擔率自實施兩稅合一以來便呈現遞減之勢；1998年租稅負擔率 (不含社會安全捐)為15.6％，1999年降為14.3％，大幅減少1.3個百分點，近年更因遺產稅、營利事業所得稅等減稅措施，2012年租稅負擔率再降為12.8％，與其他國家相較，歐美先進國家中之德國、美國，及鄰近國家之日本、韓國分別為23.2％、18.9％、16.8％、20.2％(詳附表1-1)，均較我國為高，顯示我國納稅義務人租稅負擔偏低。
另賦稅依存度亦係衡量賦稅制度良窳之重要指標，我國101年度賦稅依存度為64.7％，較87年度70.1％下降5個百分點以上（詳附圖1-1），然自87年度之後，中央政府財政收支除95年度至97年度出現為數甚低之賸餘外，其他年度均為短絀，財政赤字幾成常態；而由於政府財政缺口大部分係採舉債融通之方式支應，造成未償債務迅速累積，截至103年3月底止，各級政府公共債務（包括1年以上非自償債務及未滿1年債務）已達6兆4,754億元，財政狀況惡化嚴重。
綜上，兩稅合一制度並未達到促進投資之預期目標，反造成稅基侵蝕、稅收大幅流失，103年2月間財政部推出財政健全方案，期能健全財政並營造經濟永續發展基礎；然財政健全方案中有關兩稅合一之改革，預期對資本市場仍有所衝擊，允宜研擬相關配套措施，以減少改革阻力。本文將先說明我國兩稅合一制度沿革及各國發展情勢，並檢討兩稅合一制度實施成效，俾對兩稅合一改革方案研提建議事項。
附表1-1：主要國家租稅負擔率 單位：％
年別
我國
法國
德國
希臘
義大利
西班牙
日本
韓國
新加坡
美國
1998
15.6
28.3
21.7
22.0
29.3
21.5
17.1
17.0
15.6
21.4
1999
14.3
28.9
22.7
22.9
30.2
22.3
16.6
17.2
15.0
21.4
2000
12.8
28.4
22.8
23.8
30.0
22.4
17.3
18.8
15.5
21.8
2001
12.7
28.1
21.9
22.5
29.8
21.9
17.0
18.8
16.0
20.7
2002
11.8
27.4
21.3
22.2
29.0
22.4
15.9
18.8
13.2
18.5
2003
11.7
27.0
21.3
20.5
29.3
22.0
15.5
19.3
12.4
18.0
2004
12.2
27.4
20.8
20.2
28.5
22.8
16.2
18.4
11.9
18.3
2005
13.4
27.8
21.0
20.8
28.1
24.0
17.2
18.9
12.1
19.7
2006
13.1
28.0
22.0
20.9
29.7
24.9
17.8
19.7
12.4
20.5
2007
13.4
27.5
22.9
21.3
30.3
25.2
18.1
21.0
13.5
20.6
2008
13.9
27.3
23.1
21.0
29.6
21.0
17.4
20.7
13.9
19.1
2009
12.3
25.8
22.9
20.0
29.7
18.8
15.9
19.7
12.8
17.02010
12.0
26.3
22.0
20.5
29.5
20.3
16.3
19.3
12.8
17.6
2011
12.9
27.4
22.7
21.6
29.6
20.1
16.8
19.8
13.5
18.5
2012
12.8
28.3
23.2
23.0
30.9
21.1
…
20.2
13.7
18.9
※註：1.資料來源，財政部財政統計資料庫，上述比率不含社會安全捐。
附圖1-1： 兩稅合一實施以來各年度賦稅依存度
※註：1.資料來源，101年度財政統計年報。