財政部為改善兩稅合一減稅利益多集中於高所得者之現象，爰提出財政健全方案，將可扣抵稅額由全數扣抵改為半數扣抵，此種做法短期間雖可增裕稅收，並符合外界對增加富人稅負之期待，惟若不思改善國內投資環境，長期恐造成高所得者資金大量外流，或將資產交付海外信託，或赴租稅天堂設立公司藉以改變身分成為假外資等情形，屆時恐喪失更多稅收來源。

此外，財政健全方案亦修正綜所稅稅率結構，將稅率級距由5級調整為6級，增加年所得淨額超過1千萬元部分適用45％稅率之規定；惟兩稅合一改為半數扣抵及新增1級綜所稅率等措施，對長期持有公司股票之高薪白領階層衝擊程度甚大，應研謀有效提升國內投資環境與促進薪資成長，以降低衝擊。