檢討防洪經費運用效果不如預期原因，重要者有下列3項：
近年來防洪經費雖有顯著增加，惟洪災損失卻未相對減緩
經統計91-104年度，中央政府所投資之各項防洪經費已高達4,676.11億元，平均每年334億元；惟嗣後實際遭遇重大天災考驗時，預算轉移效果卻不如預期，致其治理成效頗受質疑；例如由農委會提供資料所示，自80年迄今，平均每年農業災害估計損失約為96.71億元，且呈現逐年上升趨勢（詳附表4-16），而上開損失雖未將人員死傷及失蹤人口計算在內，亦未考慮經濟損失等重大影響層面與範圍，但已顯示近年來政府防洪經費雖有顯著增加，洪災損失與規模卻未相對減緩。
附表4-16：各年度農業災害估計損失統計表 單位：新臺幣千元
年度
產物損失
民間設
施損失
合計
農作物
畜產
漁產
林產
小計
80
5,018,992
19,037
1,982,230
125,679
7,145,938
210,309
7,356,247
81
3,307,618
20,045
1,210,438
98,886
4,636,987
437,282
5,074,269
82
1,258,944
5,713
19,130
2,292
1,286,079
354,270
1,640,349
83
8,293,628
222,738
660,624
376,329
9,553,319
1,018,781
10,572,100
84
2,092,077
2,457
235,844
20,147
2,350,525
163,960
2,514,485
85
16,600,313
471,291
2,065,614
666,539
19,803,757
2,423,742
22,227,499
86
4,711,128
32,769
21,756
166,014
4,931,667
355,963
5,287,630
87
12,183,775
73,577
384,794
51,005
12,693,151
933,946
13,627,097
88
5,222,606
514,645
1,386,400
469,437
7,593,088
1,250,069
8,843,157
89
9,893,857
107,300
304,022
216,109
10,521,288
1,340,809
11,862,097
90
4,709,135
399,628
504,817
294,888
5,908,468
4,089,394
9,997,862
91
1,081,348
3,126
42,127
17,072
1,143,673
83,354
1,227,027
92
3,938,728
50,765
22,357
102,110
4,113,960
134,420
4,248,380
93
5,133,993
185,045
1,383,934
191,061
6,894,033
1,761,614
8,655,647
94
18,000,771
364,190
1,857,258
254,557
20,476,776
582,290
21,059,066
95
3,137,993
27,734
73,100
11,468
3,250,295
117,098
3,367,393
96
10,637,125
104,869
281,278
46,084
11,069,356
459,313
11,528,66997
12,559,055
117,984
719,862
22,816
13,419,717
872,752
14,292,469
98
10,893,704
1,556,337
4,969,907
3,107,569
20,527,517
8,604,828
29,132,345
99
8,069,760
192,430
817,612
34,860
9,114,662
623,420
9,738,082
100
3,146,149
3,171
269,381
5,458
3,424,159
15,529
3,439,688
101
5,545,099
17,667
142,941
44,924
5,750,631
595,959
6,346,590
102
9,481,411
82,764
97,934
37,812
9,699,921
436,038
10,135,959
103/5
245,084
-
-
-
245,084
21,175
266,259
合計
165,162,293
4,575,282
19,453,360
6,363,116
195,554,051
26,886,315
222,440,366
※註：1.資料來源，農委會提供。103年5月為速報資料。
2.畜產產物損失91年(含)以前包含畜禽設施損失。民間設施損失91年(含)以前係農田及漁業設施損失合計，包含政府部門與民間。
應依本院決議，積極檢討經費未能有效運用之癥結，儘速改善
本院審查水利署103年度預算時做成決議：「…，全台各地淹水事件頻傳。據統計94年至102年間全台重大颱洪災害淹水面積總計達34萬0,613公頃，且積淹水未見減緩趨勢，如98年莫拉克颱風全台之淹水面積達到7萬6,535公頃，102年8月康芮颱風僅係輕度颱風，卻造成…逾1萬7,784公頃之災情。顯見…成果欠佳。爰此，要求…就執行成效欠佳等缺失，檢討改進，…3個月內提出…成效檢討摘要報告。…。」惟囿於行政機關目前對於治理成效之衡量，仍係以保護面積與土砂抑制總量等較傳統制式化指標作為既定目標，致流於形式且失之偏狹，不能完整呈現預算執行成效，遑論依上開決議，通盤檢討各項治水方案與問題癥結，並儘速完成改善，故應建立能反映施政方向、現況偏差、與民眾期待及經費有效運用等之評核指標，俾符實需。
未即時建置災損經驗資料庫，以供政策取捨及考核治理成效
為防治水災，政府歷年來雖已投入為數可觀之預算從事防洪有關之建設，然查目前僅有農委會有較完整農業災害損失之統計資料，其他各機關則多未建置類似之颱風豪雨及災損調查分析資料庫，難以整合運用。考量即時正確之災情損失資料，除可供政策取捨之用外，亦可使各機關之施政或計畫執行成果成為客觀之課責標的，有助於檢測政府對人民需求之回應能力，爰建議參考先進國家之作法，針對洪水災害損失情形，如淹水面積、深度、機率、範圍、經濟損失及人員傷亡等資料整理紀錄，建立整合資料庫，以確實掌握淹水成因與經費投入之改善成效，俾減少不經濟支出。