空污基金102年度累計賸餘決算數高達68億9,907萬7千元(詳附表3)，惟98年度迄103年度閒置資金僅12億元存放中央銀行國庫局之定期存款，其餘鉅額資金儲放於財政部之國庫存款戶未獲孳息，實不利基金權益，顯示財務資源未能妥善管理運用，宜依空氣污染防制基金收支保管及運用辦法第4條及第6條之1規定，向財政部爭取增加基金之運用工具(投資政府債券)及規模，以增裕空污基金施政經費。

另空污基金累計賸餘龐鉅，究係各空氣污染源之徵收費率有調降空間，或各年度空污防制計畫支出規模得以擴大，或係施政不力未能妥善適時運用所徵得之空污費執行空污防制工作，或係儲備供未來年度已擬妥之空污防制計畫施政所需，環保署及空污基金管理委員會，應對空污費徵收費率及賸餘資金之運用擬妥藍圖，落實專款專用，即時執行空氣品質維護及改善工作，確保國人健康，以不負全民之所託。