政府對於各項自由貿易協定談判，因考量談判斡旋之敏感，多保持高度機密性，未適時向國內民眾傳遞相關談判方針與進展訊息，而以「利大於弊」及「談判敏感性」等理由試圖說服民眾及產業，忽略渠等對於協定簽署內容可能衝擊其生存權及工作權之不安全感，遲至完成協定簽署後，方告知民眾及產業有關貿易自由化內容。如先前兩岸服務貿易協議之簽署，因為談判過程之透明性不足，引發民眾與部分產業高度疑慮與強烈反彈，產生種種爭議，更無法凝聚共識，成為政府推動貿易自由化之重大阻礙。