依作業要點之規定，支付予公益團體、地方自治團體之緩起訴處分金，係由各地檢署組成審查小組及評估小組負責審查及監督。監督者與受監督者間應保持實質及形式上之超然獨立性，始能發揮監督成效；一般而言，監督者與受監督者間無人事、財務及業務之關聯，方可謂具超然獨立性。

作為主要支付對象之3大公益團體，與法務部及檢察機關之關係密切，說明如下：

犯罪被害人保護協會、更生保護會係依法成立之財團法人，受法務部指揮監督，依其捐助及組織章程，其專任人員之進用、服務、待遇、撫卹、福利及考績等，需經法務部核定；2者之董事長皆由台灣高等法院檢察署檢察長擔任。

榮譽觀護人協進會為社團法人，主要成員為各地檢署之觀護志工。

上述3大公益團體辦公地點多設於各地檢署：犯罪被害人保護協會21個分會均設於各地檢署；台灣更生保護會19個分會中有18個設於各地檢署；除連江地檢署外，各地檢署皆設有榮譽觀護人協進會。

綜上，3大公益團體與地檢署間，實質或形式上皆難保持超然獨立，由各地檢署負責監督公益團體對緩起訴處分金之運用情形，不具公信力。