衛生署獲配之公益彩券回饋金除98年度額外辦理協助莫拉克災民及災區民眾繳納健保欠費計畫外，歷年均辦理「協助弱勢族群排除就醫障礙，以維護弱勢族群健康」計畫，該計畫自99年度起開放各縣(市)衛生局亦可申請補助。然觀察99年度及100年度兩年度之實際執行狀況，甚大比率之衛生局執行率未及5成（詳附表8及附表9），另101年度尚有台北市、屏東縣及澎湖縣之執行率各為62.18％、55.54％及5.64％，核屬偏低，據其成果報告指出，因部分縣(市)政府衛生局之申請計畫係首年辦理，經驗較為缺乏，計畫補助對象侷限於某些病症或資格設定較為狹隘，另外部分對象已領有其他補助等因素，致計畫預估數與實際需求數有所出入，執行率較低，惟此恐已造成錯誤匡列預算額度，排擠真正需要照顧之弱勢民眾，影響補助成效。
附表8:衛生署99年度公益彩券回饋金計畫經費執行表
單位:新台幣元
計畫申請單位
核定金額
協助人次
(人次)
執行金額
賸餘金額
執行率
(％)
健保局
388,372,500
7,888
388,351,040
21,460
99.99
新竹市
1,560,000
288
407,667
1,152,333
26.13
嘉義市
147,000
5
44,590
102,410
30.33
彰化縣
1,837,500
126
659,419
1,178,081
35.89
雲林縣
1,000,000
32
70,176
929,824
7.02
臺南市
463,000
25
127,534
335,466
27.55
臺北市
3,375,000
294
1,881,117
1,493,883
55.74
聯合醫院
3,000,000
218
1,556,899
1,443,101
51.90
萬芳醫院
375,000
76
324,218
50,782
86.46
基隆市
147,000
0
7,000
140,000
4.76
臺北縣
8,610,000
4,538
8,584,900
25,100
99.71
苗栗縣
2,800,000
100
780,877
2,019,123
27.89
臺中市
300,000
3
18,729
281,271
6.24
嘉義縣
1,986,000
573
1,986,000
0
100.00
衛生署人事費
1,260,000
-
937,824
322,176
-
合計
411,858,000
13,872
403,856,873
8,001,127
98.06
※註:1.資料來源，衛生署辦理99年度公益彩券回饋金計畫成果報告書。
附表9:衛生署100年度公益彩券回饋金計畫經費執行表
單位:新台幣元
計畫申請單位
核定金額
協助人次
(人次)
執行金額
賸餘金額
執行率
(％)
中央健保局
385,842,000
18,222
385,842,000
0
100.00
嘉義縣
226,800
113
226,800
0
100.00
嘉義市
157,500
4
44,909
112,591
28.51
高雄縣
3,150,000
172
1,246,988
1,903,012
39.59
宜蘭縣
552,300
58
357,749
194,551
64.77
新北市
4,935,000
28,520
4,908,900
26,100
99.47
新竹市
1,575,000
412
884,878
690,122
56.18
臺南市
1,830,000
408
1,586,305
243,695
86.68
雲林縣
900,000
32
154,418
745,582
17.16
高雄市
2,949,200
914
2,908,908
40,292
98.63
臺北市
787,100
77
398,002
389,098
50.57
臺中市
300,000
5
41,227
258,773
13.74
新竹縣
1,575,000
74
431,469
1,143,531
27.39
桃園縣
601,500
347
164,537
436,963
27.35
花蓮縣
3,326,600
88
552,456
2,774,144
16.61
彰化縣
1,890,000
204
1,252,291
637,709
66.26
衛生署人事費
1,260,000
-
1,071,126
188,874
85.01
合計
411,858,000
49,650
402,072,963
9,785,037
97.62
※註:1.資料來源，衛生署辦理100年度公益彩券回饋金計畫成果報告書。