計畫內容:為配合產業界全球運籌經營模式之興起，及自由貿易港主導國際貿易流通等因素，行政院於91年5月所制定之「挑戰2008─國家發展重點計畫」中所列第7項子計畫「營運總部計畫」之重要執行策略之一提出「規劃自由港區」，預計執行期程為91年度至92年度。

預期成效：計畫中列載具有「活絡港口、機場相關範圍營運效益，降低廠商生產成本，吸引廠商投資，鬆綁現行轉口、加工再出口管制作業，並促進我國高附加價值貿易發展。」另依經建會91年度委託中華經濟研究院所作之「營運總部計畫影響評估分析」有關自由貿易港區整體效益推估，在假設每年台灣接單、大陸出貨的金額中10％留在台灣生產下，推估92年度至96年度實施5年間對於我國經貿影響:

產值及進出口貿易值之推估：預計5年內可創造產值共計6,180億5,985萬元、累計增加進口4,407億0,100萬元、累計創造出口6,472億8,100萬元。

誘導投資及增加就業人數之推估：預計5年內可誘導之投資金額為2,814億0,414萬元、增加僱用人數16萬9,359人。