行政院組織改造牽涉甚廣，且單一部會組織法草案之更動連帶影響其他部會組織法案，然行政院已將其次級機關組織法草案函送本院審議，部分部會卻私下遊說委員或於委員會審議時，提出修改業務歸屬內容，影響立法進度，部分未法制化機關依然存在，行政院允宜秉持建立精簡及效能組織之目標，確立各部會定位及職掌業務，積極消弭部會間之本位主義，俾免徒增國會審議困擾。