行政院自98年起推動組織改造，對組織改造法案採分批完成立法之分階段實施方式，由於未對組織改造時程及過程妥善規劃，發生諸多亂象，且迄本院第8屆第3會期第2次臨時會止，尚有內政部等10個部會尚未完成立法程序；鑒於組改期間拖延愈久，政府運作體系紊亂時間將加長，損及國家競爭力，行政院允應積極溝通協調，儘速完成立法程序，最遲不得逾行政院功能業務與組織調整暫行條例明定之103年底組織改造期限。

此外，預算案之籌編亦應配合組織改造，揭露各計畫經費移撥情形，俾使各機關年度預算編製基礎具可比較性；惟組織改造正式啟動期間（101年度及102年度）總預算案及各機關單位預算書均未表達業務、人員及經費移撥情形，致無法瞭解資源配置之合理性，核欠妥適，103年度預算案允應表達組改前後資源配置調整情況，俾落實無縫接軌。