都市更新條例自1998年11月11日公布施行至今，部分條文內容迭有爭議，各界紛紛提出修正建議，行政院爰擬具「都市更新條例修正草案」於101年12月7日函送請立法院審議，並經101年12月21日立法院第8屆第2會期第14次會議決定交付內政委員會審查，惟至今尚未完成審議。僅就現行條文較具重大爭議部分說明如下：