九六、部分特別收入基金無特定收入財源，仰賴國庫撥款，允宜檢討整併，另宜研酌建立隨收隨付基金管理制度，俾健全基金財務
按預算法第4條第1項第2款：「…歲入之供特殊用途者，為特種基金，其種類如左…(五)有特定收入來源而供特殊用途者，為特別收入基金。…。」暨行政院訂定「中央政府非營業特種基金設立及存續原則」第5點：「非營業特種基金有下列情形之一者，應以裁撤為原則：…(三)基金營運績效長期欠佳，或已喪失原訂財源，長期累積巨額短絀未能改善。…。」經查：
(一)部分特別收入基金無獨立特定收入財源，高度仰賴國庫撥款，與特別收入基金規範未盡相符
109年度中央政府總預算案計編列25個特別收入基金(詳附表1)，基金來源總計2,906億5,486萬7千元，基金用途總計2,620億3,661萬2千元，收支相抵賸餘286億1,825萬5千元，如扣除當年度政府撥入收入1,073億6,839萬5千元(占特別收入基金總來源比率36.94%)，則短絀787億5,014萬元。其中行政院國家科學技術發展基金、行政院公營事業民營化基金、花東地區永續發展基金、新住民發展基金、國土永續發展基金、毒品防制基金等基金，因欠缺獨立特定收入財源，多仰賴國庫撥款，109年度政府撥入收入占各該基金來源比率均逾90%，與特別收入基金精神未盡相符，容有檢討空間。行政院允宜針對缺乏獨立特定財源且性質類屬普通基金之特別收入基金進行改列或裁撤，俾符前揭法令規範。
(二)特別收入基金宜研酌建立隨收隨付制度，俾健全基金財務
前述25個特別收入基金之109年度預算案收支相抵後為短絀者計14個，短絀合計高達247億4,617萬元。該等基金長期累積龐大之短絀，未來極可能須由國庫資金撥補，恐成為政府沉重財政負擔。允宜參考美國部分信託基金設置精神，視基金性質研酌採取「隨收隨付制」（pay-as-you-go system），加強費用控管與使用者付費徵收，以健全基金財源。如以經濟特別收入基金為例，109年度基金來源225億3,723萬2千元，基金用途283億3,005萬7千元，收支相抵短絀57億9,282萬5千元，若依該精神，則須調高使用者徵收費率或減少支出，以維持財務健全。另行政院財政改革委員會委託研究報告指出，應力求特別收入基金自償率之推動，建議基金設立之初即需估算各年度自償率並定期評估其達成率，當其嚴重偏離時，追究相關責任，如無法自償者，則裁撤該基金；且自償率高低亦為基金設立與否之憑藉，因自償率高低將攸關國庫之最終負擔額度。
綜上，部分特別收入基金缺乏獨立特定收入財源而多仰賴國庫撥款且性質偏屬公務功能，與預算法第4條特別收入基金相關規定未盡相符，允宜檢討改編列單位預算或予以裁撤；另基金管理機制宜研酌建立隨收隨付制，強化使用者付費徵收與費用控管，以健全基金財務。
（分機：1929 吳昀雲）
附表1：109年度特別收入基金來源分析表 單位：新台幣千元
基金別
基金來源
徵收及依法分配收入
政府撥入收入
政府撥入款占基金來源比重
中央研究院科學研究基金
4,098,991
-
1,379,327
33.65%
行政院國家科學技術發展基金
39,032,148
-
37,169,991
95.23%
離島建設基金
7,140
-
-
-
行政院公營事業民營化基金
8,777,796
-
8,577,393
97.72%
花東地區永續發展基金
1,000,000
-
1,000,000
100.00%
新住民發展基金
502,033
-
500,000
99.60%
研發及產業訓儲替代役基金
484,681
478,781
-
-
警察消防海巡移民空勤人員及協勤民力安全基金
2,813
-
-
-
國土永續發展基金
97,393
-
97,393
100.00%
學產基金
823,253
-
-
-
運動發展基金
3,662,750
3,600,000
-
-
大專校院轉型及退場基金
2,190
-
-
-
毒品防制基金
471,255
-
471,255
100.00%
經濟特別收入基金
22,537,232
21,989,280
-
-
核能發電後端營運基金
26,543,616
-
-
-
航港建設基金
8,826,067
6,364,181
-
-
核子事故緊急應變基金
116,780
114,000
-
-
農業特別收入基金
63,447,310
704,500
54,813,151
86.39%
就業安定基金
25,496,574
23,899,500
213,824
0.84%
衛生福利特別收入基金
48,600,557
44,753,549
3,146,061
6.47%
環境保護基金
8,735,622
8,273,435
-
-
金融監督管理基金
26,341,746
25,577,570
-
-
通訊傳播監督管理基金
640,145
634,382
-
-
有線廣播電視事業發展基金
358,541
357,910
-
-
反托拉斯基金
48,234
46,694
-
-
合計
290,654,867
136,793,782
107,368,395
36.94%
※註：1.資料來源，整理自109度中央政府總預算案「附屬單位預算及綜計表-非營業部分」。