為符合憲法第157條及第169條規定，以及憲法增修條文第10條等規定，政府爰於各區域設置公立醫院，並補助經費以利其等營運，期能照顧弱勢民眾、平衡地區醫療資源及配合政府政策推動各項公共衛生(含預防保健、傳染病防治及緊急醫療)業務。查醫療藥品基金109 年度編列母基金及26家醫院總收入357億4,169萬3千元、各項成本及費用合計345億1,295萬5千元，收支相抵後賸餘12億2,873萬8千元，惟扣除中央政府補助經營經費37億4,210萬元，則為短絀25億1,336萬2千元。經查：
(一)自健保實施以來迄107年度，醫療能量大幅提升，而全民健保總額支付制度實施後，醫療市場競爭日趨激烈
全民健康保險於84年開始實施後，各公私立醫療機構之主要收入大多來自健保收入，且91年7月全民健康保險總額支付制度之實施，促使醫療市場競爭激烈等。茲以全民健康保險開始實施之84年及衛福部107年年報資料(醫院家數、病床數及執業醫事人員數)檢視公立醫院 (包括中央政府及地方政府權屬醫院)之醫療能量，自健保開辦以來迄107年止之24年間，醫院及公立醫院家數雖分別減少38.6%及14.7%，惟醫院及公立醫院病床數分別大幅成長33.6%及9.2%，執業醫事人員數則分別大幅成長150.7%及101.5%(詳附表1)，再加以診所家數及相關醫事人員鉅增，整體醫療服務能量呈大幅成長，主要為私立醫療機構蓬勃發展，致醫療服務業之競爭亦日趨激烈。
附表1：84年迄107年我國醫療服務量成長情形表
公立醫院
所有醫院
診所數
(家)
含診所所有醫事人員數
(人)
公立醫院占所有醫院
公立醫院醫事人力占所有醫事人力比率
家數
(家)
病床數
(床)
醫事人員(人)
家數
(家)
病床數
(床)
醫事人員(人)
家數占比
床數占比
人員
占比
84
95
39,922
26,937
787
101,430
71,350
15,317
97,257
12.1%
39.4%
37.8%
27.7%
107
81
43,606
54,277
483
135,496
178,895
22,333
257,561
16.77%
32.18%
30.34%
21.07%
成長率
-14.7%
9.2%
101.5%
-38.6%
33.6%
150.7%
45.8%
164.8%
-
-
-
-
※註：1.資料來源，衛福部。
(二)衛福部25家部立醫院107年度未含中央政府補助均呈決算短絀，109年度經營績效再呈下降者計3家，允宜積極督導改善
107年度衛福部26家部立醫院中，除桃園醫院之外，其餘25家醫院不含中央政府補助均呈決算短絀，其中尚有6家醫院即使計入中央政府補助數後仍呈短絀，相關經營績效受環境變遷及上述醫療競爭影響而欠佳。復檢視該26家部立醫院109年度預算案數，其中不含中央政府補助數呈預計賸餘者僅有桃園醫院1家，其餘均呈短絀，而其中金門醫院即使計入中央政府補助後仍呈短絀等；復查109年度預算案不包含政府補助收入之預計短絀較107年度增加者有臺南醫院、朴子醫院及旗山醫院等3家(詳附表2)，亟須督導改善。
附表2：107及109年度部立醫院營運狀況表 單位：新台幣千元
醫院名稱
107年度審定決算
109年度預算案
本期賸餘(短絀)
政府補助收入
不含中央政府補助賸餘(短絀)
本期賸餘
(短絀)
政府
補助收入
不含中央政府補助賸餘(短絀)
A組
基隆
64,348
141,375
-77,027
76,658
137,766
-61,108
臺中
63,881
192,735
-128,854
66,820
193,946
-127,126
臺南
43,008
235,847
-192,839
44,425
243,604
-199,179
臺北
105,934
246,136
-140,202
113,141248,223
-135,082
桃園
265,688
245,356
20,332
300,406
234,844
65,562
苗栗
46,519
98,951
-52,432
48,587
99,557
-50,970
豐原
79,868
135,723
-55,855
88,810
131,000
-42,190
彰化
57,827
109,731
-51,904
61,102
107,981
-46,879
屏東
66,755
147,239
-80,484
66,832
139,103
-72,271
B組
嘉義
-5,465
156,683
-162,148
3,865
152,076
-148,211
樂生
29,294
191,479
-162,185
41,770
170,110
-128,340
南投
88,265
137,074
-48,809
94,552
134,656
-40,104
朴子
-383
95,556
-95,939
1,990
107,307
-105,317
新營
9,879
115,240
-105,361
9,743
110,635
-100,892
胸腔
11,984
128,097
-116,113
13,770
123,188
-109,418
旗山
60,607
78,622
-18,015
54,982
74,777
-19,795
恆春旅遊
15,022
54,169
-39,147
12,431
50,093
-37,662
澎湖
-816
106,712
-107,528
4,396
107,756
-103,360
花蓮
-2,309
188,954
-191,263
6,875
180,616
-173,741
臺東
-1,687
191,571
-193,258
6,126
185,515
-179,389
金門
-53,912
102,829
-156,741
-45,920
97,220
-143,140
C組
八里
12,792
90,652
-77,860
14,889
86,149
-71,260
桃療
54,524
121,589
-67,065
63,708
120,171
-56,463
草療
41,695
175,132
-133,437
48,819
166,027
-117,208
嘉療
19,593
68,295
-48,702
20,976
68,036
-47,060
玉里
6,785
283,787
-277,002
22,983
271,744
-248,761
※註：1.資料來源，衛福部統計資料。
2.中央政府補助係依該部所填類別之數額表達，指中央政府對部立醫院補助相關人事及舊制年資退撫、公費養護床等營運維持經費(不含金門縣政府之協助收入、相關教學及臨床醫事人員補助等)。以下各題之中央政府補助定義皆按前述說明。
(三)新設中大型醫院加入營運，將影響部分部立醫院之經營績效，允宜及早籌謀因應
查衛福部依醫療法規定許可設立或擴充，且於108至112年預計營運之醫(分)院計有12家，由於多位於交通便捷區域且多屬中大型醫院，爰未能改善醫療資源分布不均情形，尚影響同區域部立醫院之經營，主要受影響之部立醫院有樂生療養院、臺北醫院、彰化醫院、桃園療養院、桃園醫院及屏東醫院等(詳附表3)。復查未來尚有教育部成大醫院預計新設老人醫院及高齡醫藥智慧照護發展教育中心(預計114年開始營運)，部立醫院可能受影響者為同次區域之臺南醫院、胸腔病院及嘉南療養院等，允宜及早籌謀因應，以免前揭醫院經營績效惡化。
附表3：108至112年預計營運之新設醫(分)院說明表
年
醫院名稱
醫院規模
(急性一般病床數)
預計建院經費
(億元)
1.醫療次區域
2.主要競爭醫院(公立醫院部分)
108
1.國立臺灣大學醫學院附設癌醫中心醫院
432床
約158.28
1.次區域：臺北東區次醫療區
2.公立醫院：臺北市立聯合醫院、三軍總醫院松山分院
2.財團法人私立高雄醫學大學高醫岡山醫院
350床
約3.35
1.次區域：高雄岡山次醫療區
2.公立醫院：國軍高雄總醫院左營分院及岡山分院、高雄榮民總醫院、高雄市立岡山醫院（委託秀傳醫療社團法人經營）
3.醫療財團法人正德癌症醫療基金會佛教正德醫院
安寧病床90床
約7.90
1.次區域：臺中屯區次醫療區
2.公立醫院：法務部矯正署臺中監獄附設培德醫院、國軍臺中總醫院
109
4.國立臺灣大學醫學院附設醫院新竹生醫園區分院
495床
約67.00
1.次區域：新竹竹北次醫療區
2.公立醫院：無其他公立醫院
5.新北市立土城醫院
(委託長庚醫院經營)
499床
約70.00
1.次區域：臺北西區次醫療區
2.公立醫院：衛生福利部樂生療養院、衛生福利部臺北醫院
6.南迴醫療財團法人南迴醫院
20床
約3.00
1.次區域：台東大武次醫療區
2.公立醫院：無其他公立醫院
7.義大醫療財團法人屏東義大醫院
495床
約42.80
1.次區域：屏東屏東次醫療區
2.公立醫院：衛生福利部屏東醫院、國軍高雄總醫院附設屏東民眾診療服務處、高雄榮民總醫院屏東大武分院(未開業)、高雄榮民總醫院屏東分院
111
8.長恩醫院
99床
-
1.次區域：臺北西區次醫療區
2.公立醫院：衛生福利部樂生療養院、衛生福利部臺北醫院
9.員榮醫療社團法人員林醫院
199床
約29.00
1.次區域：彰化北彰化次醫療區
2.公立醫院：衛生福利部彰化醫院
10.八德長榮醫院
150床
約2.94
1.次區域：桃園桃園次醫療區
2.公立醫院：衛生福利部桃園療養院、臺北榮民總醫院桃園分院、衛生福利部桃園醫院、
112
11.竹銘醫療財團法人憶卿醫院
300床
約48.00
1.次區域：新竹新竹次醫療區
2.公立醫院：國立臺灣大學醫學院附設醫院新竹分院、國軍新竹地區醫院附設民眾診療服務處
12.高雄榮民總醫院屏東大武分院
450床
約94.63
1.次區域：屏東之屏東次醫療區
2.公立醫院：衛生福利部屏東醫院、國軍高雄總醫院附設屏東民眾診療服務處、高雄榮民總醫院屏東分院
※註：1.資料來源，衛福部，有底線者為公立醫院。
綜上，自健保實施以來，我國公私立醫療能量均大幅提升，尤其在都會區，民間醫療資源充沛，大幅削減部立醫院擔負之公醫任務，同時亦壓縮部立醫院醫療市場空間，而全民健保總額支付制度實施後，醫療市場競爭日趨激烈；衛福部部立25家醫院107年度未含中央政府補助均呈短絀，經營績效欠佳，而109年度績效再呈下降者計有3家醫院，允宜積極督導改善；另近期將有數家新設中大型醫院加入營運，恐再影響部分部立醫院經營成效，允宜及早籌謀因應，俾利提升經營績效。