醫療發展基金係醫療法第91條、第92條規定設立，109年度預算案基金來源19億2,682萬元，基金用途25億7,558萬3千元，基金來源用途相抵後短絀6億4,876萬3千元，較108年度預算案短絀減少10億9,204萬9千元(減幅62.73%)，將移用以前基金餘額支應；該基金係補助醫療資源不足地區設置醫療機構與護理機構及鼓勵醫事人員前往提供醫療服務，以及強化醫療機構服務等業務。謹將109年度預算案評估如下：