109年度「科技專案」預算數154億9,571萬4千元，較108年度預算數147億9,609萬5千元，增加6億9,961萬9千元，增幅4.73%，占經濟部109年度歲出預算數之79.72 %(「科技專案」各分支計畫及用途別科目金額，詳附表1)。經查：
附表1：「科技專案」計畫108及109年度預算編列比較概況表
單位：新臺幣千元
分支計畫及
用途別科目
108年度法定預算數
109年度
預算案數
增減比較
金額
比率
1.科技行政管理
85,696
85,558
-138
-0.16%
人事費
57,791
57,603
-188
-0.33%
業務費
18,329
18,375
46
0.25%
設備及投資
76
80
4
5.26%
獎補助費
9,500
9,500
-
-
2.政策研究與推動計畫
804,447
786,898
-17,549
-2.18%
業務費
330,742
342,525
11,783
3.56%
獎補助費
473,705
444,373
-29,332
-6.19%
3.工研院科技專案計畫
7,386,136
7,940,469
554,333
7.51%
獎補助費
7,386,136
7,940,469
554,333
7.51%
4.資策會科技專案計畫
1,089,133
1,049,896
-39,237
-3.60%
獎補助費
1,089,133
1,049,896
-39,237
-3.60%
5.中科院科技專案計畫
323,740
-
-323,740
-
獎補助費
323,740
-
-323,740
-
6.其他法人科技專案計畫
2,429,831
2,649,605
219,774
9.04%
獎補助費
2,429,831
2,649,605
219,774
9.04%
7.業學界科技專案計畫
2,677,112
2,983,288
306,176
11.44%
獎補助費
2,667,112
2,983,288
306,176
11.44%
科技專案合計
14,796,095
15,495,714
699,619
4.73%
※註：1.資料來源，整理自經濟部108年度法定預算書及109年度預算案。
2.109年度預算案將108年度之「中科院科技專案計畫」併入「其他法人科技專案計畫」內。
(一)109年度「科技專案」預算數逾97%為獎補助費，且較108年度增加近7億元，執行成果之良窳攸關政府資源使用效益
1.為有效掌握全球發展趨勢主軸，規劃開發以創新為導向之前瞻性、關鍵性或共通性之產業技術，並配合產業創新政策之推動，擘劃我國中長期產業定位及研發重點，以引領產業結構優化，提升國家競爭能力，經濟部技術處依據產業創新條例第9條規定辦理科技專案計畫，持續補助法人研究機構進行產業技術研發與創新。109年度「科技專案」預算數154億9,571萬4千元，較108年度預算數增加6億9,961萬9千元(增幅4.73%)，相較107年度決算數157億5,696萬2千元，則減少2億6,124萬8千元(減幅1.66%)。109年度「科技專案」計畫中「獎補助費」科目150億7,713萬1千元，占該計畫比率達97.30%。
2.按107年1月修正「落實零基預算精神強化預算編製作業精進措施」第5點二、原有計畫及預算之檢討之規定：「（六）科技發展計畫之審查宜採『績效』及『成果』導向，重視成果效益及分年目標之設定及達成情形里程碑等，如未具效益或未合時宜之計畫應予退場，以控留額度容納具效益或配合政策推動計畫，俾使有限資源發揮最大綜效。」故經濟部技術處對補捐助法人研究機構辦理科技專案計畫之產業技術研發成果，以及研發成果後續移轉產業界等相關查核考評工作至為重要，倘如法人研究機構於執行科專計畫未達績效目標，或執行之計畫未具效益時，則宜考慮退場，以控留額度容納具效益或配合政策推動計畫，俾利政府資源發揮最大綜效。
(二)107年度部分受補助財團法人，對於執行法人科技專案計畫之績效評核及研發成果尚有提升改進空間
1.經濟部技術處法人科技專案計畫 (以下簡稱法人科專)主要由財團法人工業技術研究院、資訊工業策進會、生物技術開發中心、金屬工業研究發展中心等20個研究機構，推動執行前瞻性、關鍵性產業之技術研發，並完善研發環境及基礎設施。按經濟部109年度預算書之總說明所載，經濟部技術處107年度投入於5G產業技術與通訊系統應用、人工智慧關鍵技術與產業應用等多個技術領域，並獲致成果如下：(1)法人科專計申請專利1,754件，獲得專利1,524件，專利應用約1,188件，技術移轉約1,245件，研發成果收入約15.76億元，促進產業投資577.58億元，且7成以上技術移轉係協助中小企業，有助產業累積科技研發智財能量。(2)榮獲包括4項美國百大科技研發獎(R&D 100 Awards)及3項德國iF設計獎(iF Design Award)等國際大獎肯定。(3)透過補助帶動企業研發投入達43.39億元、促進就業664人次，且受補助廠商有49.8%屬中小企業，平均政府每投入1元，可帶動8.43元之直接及衍生投資效果。
2.惟據審計部107年度中央政府總決算審核報告指出，經查核107年度法人科專計畫執行結果，部分受補助法人研究機構存有連續 2年評核為良，等第連年居末(如財團法人鞋類暨運動休閒科技研發中心等)、評核等第由優轉良、等第下降(如財團法人車輛研究測試中心等)、年度執行成果未達績效目標值等缺失(如財團法人商業發展研究院辦理促進廠商投資金額達成率僅為11％等；詳附表2)，容有檢討改善之處。
綜上，政府長期投入科技研發龐鉅經費，109年度「科技專案」賡續編列154億9,571萬4千元，較108年度增加6億9,961萬9千元，惟107年度法人科專計畫執行結果，其中部分受補助法人研究機構辦理科技專案計畫執行成果未達績效目標、評核成績連年居末或評核等第下降等情形，宜積極研謀改善，以有效發揮政府資源效益並達成產業創新等政策目標。
附表2：107年度法人科技專案計畫績效評核及研發成果情形表
績效評核及研發成果情形
法人機構名稱
連續 2年評核為良，等第連年居末
財團法人鞋類暨運動休閒科技研發中心
財團法人醫藥工業技術發展中心
財團法人商業發展研究院
評核等第由優轉良，等第下降
財團法人車輛研究測試中心
財團法人石材暨資源產業研究發展中心
財團法人印刷工業技術研究中心
107年度執行成果未達績效目標值
財團法人自行車暨健康科技工業研究發展中心（專利獲得達成率67％）
財團法人鞋類暨運動休閒科技研發中心（專利應用達成率67％）
財團法人生物技術開發中心（專利獲得、專利應用及研發成果收入繳庫達成率分別為55％、95％及72％）
財團法人國家衛生研究院（專利申請達成率38％）
財團法人商業發展研究院（促進廠商投資金額達成率11％）
※註：1.資料來源，整理自107年度中央政府總決算審核報告，乙-393頁，及經濟部技術處法人科技專案網頁，https://www.moea.gov.tw/MNS/doit/content/Content.aspx?menu_id=13395。
2.本表係經濟部107年度考評106年度法人研究機構之執行績效。