海保署109年度預算案於「海洋保育業務-海洋環境管理作業」項下編列海域水質監測計畫730萬元，係辦理檢測及監控海域水體等業務，以掌握海域環境品質，較108年度預算數145萬5千元增加584萬5千元，增幅約4.02倍。經查：
(一)近4年我國海域水質監測情形良好，呈現穩定之趨勢
行政院環境保護署(以下稱環保署)自91年起每季針對沿海海域水質進行監測，初期於臺灣本島及澎湖沿海設置97個監測站進行監測，94年起增加金門、連江、東引等海域監測，目前計有20處海域共105個測站。
我國海域監測採樣頻率為每季1次，監測項目包括水溫、pH值、氨氮、鹽度、溶氧量、懸浮固體、硝酸鹽氮、亞硝酸鹽氮、磷酸鹽、矽酸鹽、葉綠素a與重金屬之鎘、鉻、鉛、汞、銅、鋅共計17項，
由環保署107年環保署之環境水質年報資料觀之，係以全國近海 20 處海域 105 處測站中，監測項目與海域環境分類及海洋環境品質標準相關者之pH、溶氧量、鉛、銅、汞、鋅及鎘等7 項水質，加以比較所得合格率作為績效評估基準。由104年至107年（詳附表1）監測結果比較可知，近4年臺灣近海海域7 項水質達成率介於 99.7%～99.9%之間，其中鎘、鉛、鋅、汞等項目之達成率皆維持為100%，且pH值及溶氧量監測結果達成率亦達99%以上，呈現穩定之趨勢，顯示我國近海海域水質良好，上開業務自108年起由海保署接續辦理。
附表1：104年至107年海域水質達成率
年度
項目
pH 值
溶氧量
鎘
銅
鉛
鋅
汞
合計
104
達成數
420
416
420
420
420
420
420
2,936
總監
測數
420
420
420
420
420
420
420
2,940
達成率
100.0
99.0
100.0
100.0
100.0
100.0
100.0
99.9
105
達成數
418
417
420
420
420
420
420
2,935
總監
測數
420
420
420
420
420
420
420
2,940
達成率
99.5
99.3
100.0
100.0
100.0
100.0
100.0
99.8
106
達成數
417
420
420
419
420
420
420
2,936
總監
測數
420
420
420
420
420
420
420
2,940
達成率
99.3
100.0
100.0
99.8
100.0
100.0
100.0
99.9
107
達成數
416
418
420
417
420
420
420
2,931
總監
測數
420
420
420
420
420
420
420
2,940
達成率
99.0
99.5
100.0
99.3
100.0
100.0
100.0
99.7
※註：1.資料來源，整理自環保署之107年環境水質年報。
2.達成率指各項水質指標項目符合海洋環境品質標準之比率。
3.上表所述的達成數與總監測數分別指104年至107年第1季至第4季總數。
(二)海洋保育網之海域水質監測主題數據未定期更新，允宜檢討改善
海保署權責執掌依照海洋委員會組織法第2條第3款：「海洋環境保護、資源管理、永續發展、生物多樣性保育與污染防治之統合規劃、審議、協調及推動。」及海洋委員會海洋保育署組織法第2條：「本署掌理下列事項：一、海洋生態環境保護之規劃、協調及執行。二、海洋生物多樣性保育與復育之規劃、協調及執行。…五、海洋污染防治之整合規劃、協調及執行。…。」是以，海保署辦理海洋生態保育與海洋資源永續管理業務，並承接環保署移撥海洋污染延續業務。
復依水污染防治法第10 條規定：「各級主管機關應設水質監測站，定期監測及公告檢驗結果，並採取適當之措施。前項水質監測站採樣頻率，應視污染物項目特性每月或每季1次為原則，必要時，應增加頻率。…。」另海洋污染防治細則第6條規定：「中央主管機關應就全國性海域水體，依其海域環境分類設置海域環境監測站；…。各級主管機關應於每年4月15日前，公布前1年之海域環境監測資料。」又海域環境監測及監測站設置辦法第4 條規定：「海域環境監測頻率以每季1次為原則。但發生海上重大污染時，應依中央主管機關指定之頻率辦理。」是以，海保署為海域水質監測主管機關，依上開規定應每年定期公布海域水質監測數據。經查該署於海洋保育網中已建置海域水質監測主題，整合環保署全國環境水質監測資訊網自96 年起105 個測站之各測項數值資訊，及地方政府環保局96 至105 年於臺灣沿海設置139 個水質監測站之監測資料，並以互動式之地理資訊圖臺方式呈現。惟該署辦理108 年度海域水質監測計畫，因招標作業延後致截至108年10月15日止，尚未公布108 年第1 季海域水質監測數據，致使海洋保育網中水質監測數據欠缺完整性，該署允宜檢討改善並定期更新質海洋保育網之海域水質監測數據，以確保資訊完整，利於民眾查詢。
綜上，海洋保育署已介接環保署之海域水質監測資料，惟辦理108 年海域水質監測計畫，因招標作業延後致尚未公布第1 季海域水質監測數據，允宜檢討改善並定期更新質海洋保育網之海域水質監測數據，以確保資訊完整，利於民眾查詢。