航港建設基金109年度「臺灣國際商港未來發展及建設計畫(106-110年)－航港建設基金辦理部分」編列46億4,669萬元，較108年度預算案之27億7,014萬3千元，增加18億7,654萬7千元。經查：
(一)各年度計畫經費分配概況
商港法第6條第1項規定：「商港區域之整體規劃及發展計畫，由商港經營事業機構、航港局或指定機關徵詢商港所在地直轄市、縣(市)政府意見擬訂，並報請主管機關或層轉行政院核定。」交通部自84年度起以每5年為一週期規劃訂定我國商港整體發展規劃，再由各國際及國內商港經管單位參照上位發展方向，據以訂定各商港未來5年發展建設計畫。第5期「國際商港未來發展及建設計畫(106-110年)」（以下簡稱「國際商港計畫(106-110年)」）經行政院於105年11月核定，復於107年3月及108年4月准予修正備查在案，修正後計畫新興項目總經費615億5,697萬7千元，航港建設基金負擔350億845萬3千元、臺灣港務股份有限公司(以下簡稱港務公司)負擔265億4,852萬4千元(含前瞻基礎建設計畫特別預算18億5,000萬元)，各年度經費分配概況詳附表1。
附表1：「國際商港計畫(106-110年)」各年度經費分配概況表
單位：新臺幣千元
年度
航港建設基金
港務公司
合計
106
718,060
1,743,000
2,461,060
107
1,565,850
1,430,000
2,995,850
108
2,770,143
3,198,750
5,968,893
109
4,646,690
3,116,852
7,763,542
110
12,654,923
6,280,346
18,935,269
111以後
12,652,787
10,779,576
23,432,363
合計
35,008,453
26,548,524
61,556,977
※註：1.資料來源，航港建設基金及港務公司109年度預算案；本報告整理。
2.港務公司負擔265億4,852萬4千元，資金來源含前瞻基礎建設計畫特別預算18億5,000萬元。
(二)各子計畫工程進度多依修正後計畫預定進度執行
「國際商港計畫(106-110年)」於105年11月經行政院核定後，自106年起執行，復於107年3月及108年4月經行政院准予修正，各子計畫經費得於整體計畫項下調整支應。航港建設基金辦理部分106至108年度累計編列預算50億5,405萬3千元，截至108年8月底累計執行數36億4,500萬4千元，累計預算執行率為72.12%，各子計畫工程進度除「臺中港海岸保全工程計畫」外，均依修正後計畫預定進度執行(詳附表2)。
(三)計畫修正頻繁，允宜妥為規劃並落實執行控管
行政院於107年3月准予備查「國際商港計畫(106-110年)」第1次修正案時，請交通部「督導所屬確實掌握進度，避免計畫延宕」；108年4月准予備查該計畫第2次修正案，函復「本案於同一年度提報2次修正計畫，顯見相關規劃周延性及執行率均有待改進」。
航港建設基金辦理「國際商港計畫(106-110年)」，截至108年8月底累計預算執行率較低之子計畫(詳附表2)，多已修正計畫，106、107年度預算並於「國際商港計畫(106-110年)」項下調整支應其他子計畫。例如：「基隆港濱海觀光遊憩專區基礎公共設施改善工程」(累計預算執行率0%)因應基隆市政府及海洋大學對濱海遊憩區開發規劃未定，已暫緩辦理並調減經費；「基隆港航道、迴船池水域加深浚挖工程及土方收容填區圍堤工程」(累計預算執行率20.69%)因規劃圍堤長度縮短，完工期程提早，並調減計畫經費；「臺北港物流倉儲區第三、四期圍堤工程計畫」(累計預算執行率13.42%)配合政府推動循環經濟，將二期中隔堤回收再利用，移置南碼頭區作為護岸使用等。
附表2：「臺灣國際商港未來發展及建設計畫(106-110年)－航港建設基金辦理部分」之預算編列及執行情形彙整表
單位：新臺幣千元；%
子計畫名稱
109年度
預算案數
截至108年度累計編列預算數
截至108年8月
累計
執行數
累計
預算
執行率
工程進度預定
實際
1.基隆港濱海觀光遊憩專區基礎公共設施改善工程
0
9,500
0
0.00
0.00
0.00
2.基隆港軍用碼頭遷建及後線設施整建工程
695,000
410,000
133,771
32.63
65.00
65.00
3.基隆港航道、迴船池水域加深浚挖工程及土方收容填區圍堤工程
460,000
60,000
12,414
20.69
50.00
50.00
4.臺北港公共設施工程計畫
693,000
1,098,800
949,402
86.40
50.00
50.00
5.臺北港南碼頭區B填區圍堤造地工程計畫
431,500
519,000
421,703
81.25
56.00
56.00
6.臺北港物流倉儲區第二期造地工程計畫
87,000
317,560
190,650
60.04
63.91
63.91
7.臺北港物流倉儲區第三、四期圍堤工程計畫
900,000
446,050
59,842
13.42
43.00
43.00
8.臺中港海岸保全工程計畫
100,000
156,000
114,284
73.26
50.89
47.43
9.臺中港外港區擴建計畫(第一期)
126,845
0
0
-
0.00
0.00
10.高雄港第七貨櫃中心計畫-基礎設施工程
903,345
0
0
-
0.00
0.00
11.高雄港洲際貨櫃中心第二期散雜貨碼頭區公共設施工程計畫
250,000
250,000
69,441
27.78
55.00
55.00
12.高雄港港勤船渠造地工程
0
24,000
7,435
30.98
0.00
0.00
13.高雄港區土地取得作業
0
1,686,063
1,686,062
100.00
100.00
100.00
14.安平港四鯤鯓航道浚深工程
0
77,080
0
0.00
0.00
0.00
合計
4,646,690
5,054,053
3,645,004
72.12
※註：1.資料來源，交通部航港局提供及航港建設基金109年度預算案；本報告整理。
2.本表表列106至109年度編列預算之子計畫。
3.截至108年8月累計預算執行率=截至108年8月累計執行數/截至108年度累計編列預算數。
綜上，「國際商港計畫(106-110年)」於105年11月經行政院核定後，自106年起執行，復於107年3月及108年4月經行政院准予修正，各子計畫經費得於整體計畫項下調整支應，迄108年8月底，航港建設基金辦理部分之各子計畫多依修正後計畫預定進度執行。計畫修正雖有部分因素係配合政策考量，及實際執行環境滾動檢討，惟修正頻繁，行政院亦函復相關規劃周延性及執行率均有待改進，允宜妥為規劃並落實執行控管，以維計畫之有效推動。