農村再生基金109年度編列基金用途111億1,785萬元，分別較108年度預算88億4,000萬元增加22億7,785萬元(增幅25.77%)，及較107年度決算70億5,007萬7千元增加40億6,777萬3千元(增幅57.70%)，主要係自109年度起執行農村再生第3期實施計畫(以下簡稱農再第3期計畫)所需經費較高所致，惟所訂關鍵績效指標卻較107年度實際值低，未盡合理。茲說明如下：
(一)農再第3期計畫較第2期計畫總經費增加166.23億元，且所訂6項預期績效指標均與第2期同
農再第3期計畫期程為109至112年度，計畫總經費403.80億元，較農村再生第2期(105至108年度)實施計畫(以下簡稱農再第2期計畫)總經費237.57億元，增加166.23億元，所訂之年度績效指標為吸引青年留農或返農人數、創造就業機會人數、帶動年度農業及農村休閒旅遊人次、增加農業及農村經濟產值、推動農村活化再生社區數，及改善農村再生社區整體環境品質面積等6項，較農再第2期計畫所訂7項指標減列「提升大專業農年所得」1項，餘均相同。
(二)「創造就業機會」及「改善農村再生社區整體環境品質面積」2項目標，迄107年度實際值均高於農再第3期計畫之預期目標值
農再第2期計畫原核定4年度總需求經費304.41億元，嗣依各年度執行狀況後調整之總經費為237.57億元，並配合年度預算調整各年度之績效目標值，依農委會所提供之資料(詳附表1)，迄107年度實際創造就業機會為2萬7,502人，且觀105及106年度亦分別達8,257人及1萬7,286人，均高於農再第3期計畫各年度之目標值(每年約7千餘人)；另「改善農村再生社區整體環境品質面積」105至107年度之實際績效值亦均高於農再第3期計畫年度目標值，未盡合理。依該會說明略以：「…『創造就業機會』係重新檢討各計畫計算方式，以實際就業人數不重複方式重新估算之目標值，另『改善農村再生社區整體環境品質』係以各年度農村建設資源投入，可實質改善或提升農村再生社區整體環境品質之面積為衡量指標…。」惟觀農再第2期與第3期計畫書中對該2項指標之定義說明差異不大(詳附表2)，然兩計畫間之績效目標值差距不小，允宜檢討再提升之可能性。
附表1：農再第3期計畫與第2期計畫之經費及績效指標彙整表
績效指標/
經費需求
農再第2期計畫各年度目標值
農再第3期計畫各年度目標值
105年
106年
107年
108年
4年目標
109年
110年
111年
112年
4年目標
1.吸引青年留農或返農(人數/年)
4,053
5,798
4,608
4,558
15,707
7,270
7,780
7,790
7,800
30,640
2.創造就業機會(人/年)
8,257
17,286
27,502
22,170
84,427
7,015
7,590
7,700
7,760
30,065
3.帶動年度農業及農村休閒旅遊(萬人次/年)
3,610
4,104
4,107
3,773
3,730
4,150
4,180
4,210
4,240
4,195
4.增加農業及農村經濟產值(億元/年)
170
192
190
169
669
198
201
203
207
809
5.提升大專業農所得(萬元/年)
142
153
156
141
136
-
-
-
-
-
6.推動農村活化再生(累計社區數)
2,201
2,402
2,402
2,040
2,040
2,585
2,855
3,130
3,400
3,400
7.改善農村再生社區整體環境品質面積(公頃/年)
4,520
4,067
4,663
4,156
16,966
1,570
1,570
1,575
1,575
6,290
經費需求(新台幣億元)
50.36
48.93
62.46
75.82
237.57
97.58
99.79
102.13
104.30
403.80※註：1.資料來源，農再第3期(109-112年度)計畫與農再第2期(105-108年度)計畫之計畫書(核定本)，及農村再生基金各年度預、決算書。
2.表列農再第3期計畫經費為計畫核定之經費需求數；農再第2期計畫經費為105至107年度決算數加計108年度預算案數，4年目標值為4年經費需求總和。
3.表列農再第2期計畫各年度目標值105至107年度為實際值；108年度為目標值，4年目標係依各年度預算數調整後之總預期目標值；農再第3期計畫所列各年度目標值均為預期績效目標值。表列績效指標之4年目標除「帶動年度農業及農村休閒旅遊」及「提升大專業農所得」為4年度平均值外，餘為4年累計目標。
附表2：農再第3期計畫與第2期計畫中對「創造就業機會」及「改善農村再生社區整體環境品質面積」績效指標之定義說明
績效指標
農再第2期計畫績效指標說明
農再第3期計畫績效指標定義說明
創造就業機會(人/年)
包括透過專業職能訓練、提供農業生產設施與技術協助、輔導農村產業升級加值、實施農村社區三生建設、引進青年農業人力、發展農業及農村旅遊市場等措施所新創或促進之各種年度就業機會人數
透過各類輔導措施，持續改善農業勞動條件，包括透過專業職能訓練、提供農業生產設施與技術協助、輔導農村產業升級加值、實施農村社區三生建設、引進青年農業人力等措施所新 創或促進之各種年度就業機會人數；此外納入地方政府共同執行農村再生，對接我國地方創生國家戰略計畫， 優化地方產業，鞏固就業機會。
改善農村再生社區整體環境品質面積(公頃/年)
農村社區生產、生活及生態環境之改善係農村再生計畫資源投入重點項目之一，故新增以各年度農村建設資源投入後，可實質改善或提升農村再生社區整體環境品質之面積數為績效指標衡量標準。
農村社區生產、生活及生態環境之改善，為農村再生計畫資源投入重點項目之一， 以各年農村建設資源投入，可實質改善或提升農村再生社區整體環境品質之面積數進行統計 。
※註：1.資料來源，農再第2期(105-108年度)計畫及農再第3期(109-112年度)計畫與之計畫書(核定本)。
綜上，農村再生第3期計畫總經費較第2期增加166.23億元，惟部分績效評估指標之目標值低於107年度實際值，未盡合理，允宜檢討再提升之可能性，俾利達農村再生條例所定設置本基金辦理推動農村永續發展及活化再生相關事項之立法意旨。