水資源作業基金(個別，以下均同)109年度編列收入總額84億6,948萬元、費用總額95億689萬7千元，收支相抵後預計短絀10億3,741萬7千元。經查：
(一)105至109年度基金收支概況
比較近5年度(105至109年度，以下同)水資源作業基金收支概況(詳如附表1)，該基金已連續5年度呈短絀，108及109年度預計短絀數各為11億6,566萬6千元及10億3,741萬7千元，較以前年度短絀情形擴增，茲評估說明如下：
1.近5年來銷貨收入成長有限，108及109年度業務收入之增加主要為「徵收收入」新增耗水費收入每年度8億元所致。
2.107至109年度業務收支轉呈短絀情形，依該基金各年度預決算書之說明，107年度主要為給水收入未如預期，以及緊急搶險搶修工程較預期多，致土石銷貨成本增加；108及109年度因擴大水庫清淤工程，湖山水庫完工移撥所需提列折舊費用增加等，致業務收入不敷支應業務支出；加以108年度補助嘉南農田水利會辦理新烏山嶺引水隧道工程，109年度配合執行重大水資源規劃作業等，致基金短絀擴增。
(二)近年短絀數升高，成本控管機制，亟待檢討強化
水資源作業基金屬預算法第4條第2款所定凡經付出仍可收回，而非用於營業者之作業基金；行政院所訂「附屬單位預算共同項目編列作業規範」亦規定，作業基金應依設立目的，考量其財務能力，本自給自足原則，力求有賸餘無短絀，年度賸餘應以逐年成長(短絀積極改善)為目標。
水資源作業基金近5年度「業務成本與費用」占「業務收入」之比率逐年增高，109年度預算占比112.35%，較105至107年度決算平均98.51%及108年度預算101.62%，分別增加13.84個百分點及10.73個百分點，增加幅度頗大，即使考量因湖山水庫等新水利設施投入營運，所需折舊分攤逐年增加，惟以109年度「折舊、折耗及攤銷」占業務收入19.78%，與105年度14.58%比較，近5年度增加率僅約5.2個百分點，遠低於其業務成本與費用增加幅度，成本控管機制亟待檢討強化；又以109年度「行銷及業務費用」占業務收入比率22%，亦較105至107年度決算均未逾20%為高，各項經常支出亦容有檢討撙節之空間。
綜上，水資源作業基金近5年度收支均呈短絀，108及109年度預計短絀高逾10億元，基金經營績效亟待檢討改善，允宜審酌基金收入情形，詳實評估各項業務推動優先順序及所需經費需求規模之妥適性，力求節約，以維基金財務之健全發展。
附表1：105至109年度水資源作業基金收支概況表
單位：新臺幣千元；%
年度
105決算
106決算
107決算
108預算案
109預算案
金額
占比
金額
占比
金額
占比
金額
占比
金額
占比
業務收入
6,846,740
100.00
7,398,289
100.00
7,041,290
100.00
8,033,332
100.00
8,234,570
100.00
1.銷貨收入
5,174,652
75.58
5,742,893
77.62
5,273,216
74.89
5,631,055
70.10
5,714,671
69.40
(1)給水
1,811,112
26.45
1,945,249
26.29
1,944,656
27.62
2,056,273
25.60
2,111,349
25.64
(2)售電
884,399
12.92
801,459
10.83
800,767
11.37
867,186
10.79
859,679
10.44
(3)土石
2,479,141
36.21
2,996,185
40.50
2,527,792
35.90
2,707,596
33.70
2,743,643
33.32
2.徵收收入
1,328,832
19.41
1,364,885
18.45
1,372,561
19.49
2,080,000
25.89
2,155,426
26.18
3.其他
343,256
5.01
290,511
3.93
395,513
5.62
322,277
4.01
364,473
4.43
業務成本與費用
6,501,907
94.96
7,095,254
95.90
7,372,417
104.70
8,163,343
101.62
9,251,872
112.35
1.勞務成本
69,982
1.02
70,288
0.95
71,037
1.01
79,461
0.99
78,960
0.96
2.銷貨成本
4,411,184
64.43
4,969,335
67.17
5,197,342
73.81
5,528,291
68.82
6,554,141
79.59
(1)給水
2,326,421
33.98
2,635,521
35.62
2,779,169
39.47
3,356,804
41.79
4,114,365
49.96
(2)售電
401,238
5.86
391,267
5.29
382,558
5.43
442,088
5.50
482,514
5.86
(3)土石
1,683,525
24.59
1,942,547
26.26
2,035,615
28.91
1,729,399
21.53
1,957,262
23.77
3.行銷及業務費用
1,325,079
19.35
1,367,688
18.49
1,374,957
19.53
1,742,560
21.69
1,811,643
22.00
4.管理及總務費用
125,116
1.83
109,436
1.48
107,348
1.52
141,073
1.76
136,062
1.65
5.其他
570,546
8.33
578,507
7.82
621,732
8.83
671,958
8.36
671,066
8.15
業務餘絀
344,834
303,035
-331,127
-130,011
-1,017,302
業務外餘絀
-1,232,143
-566,929
-547,426
-1,035,655
-20,115
本期短絀
-887,310
-263,894
-878,554
-1,165,666
-1,037,417
折舊、折耗及攤銷
998,181
14.58
1,153,236
15.59
1,151,031
16.35
1,493,240
18.59
1,629,165
19.78
※註：1.資料來源，水資源作業基金各年度預決算書。105至107年度為決算審定數，108及109年度為預算案數。各細項加總與合計之差異為尾數四捨五入所致。