早期政府為照顧經濟弱勢民眾、平衡地區醫療資源及推動公共衛生政策而設置公立醫院，惟91年7月全民健康保險實施總額支付制度後，限縮全民健康保險醫療費用成長，醫療市場競爭日趨激烈，醫院亦朝向大型私有化發展，公立醫院在嚴峻競爭下，多數營運入不敷出，仰賴公務預算補助。以衛生福利部(以下簡稱衛福部)所屬醫療院所為例，104年度26家部立醫院占公立醫院僅3成，惟因部立醫院直接受衛福部督辦醫療及公衛任務，對我國醫療照護及公共衛生任務之達成有其重要性，又多數部立醫院長期仰賴公務預算補助，營運入不敷出，爰本報告就衛生福利部所屬醫院經營現況、面臨之困難，檢討部立醫院醫療品質及競爭力提升問題，並研議因應策略，以供參考。